六道口站

六道口站为地下双层车站，双柱三跨结构，岛式站台设计，采用暗挖法施工[2]。车站将管线布置在两侧，使得中跨可以不设置吊顶，直接抹灰加上灯具装饰，以追求更高的空间效果[3]。昌平线车站则为双柱三跨岛式暗挖车站，轨行区下穿15号线站台[4]，以学院路高校的苏式建筑特点及材质色彩为设计依据，将砖红色定为主题色，并将中国农业大学老校门拱券造型的元素运用到车站的装修中[5]。

地面层	地面	A－D出入口
地下一层 站厅层	15号线站厅	客务中心、自动售票机、进出站闸机
地下二层 站台层	昌平线站厅	客务中心、自动售票机、进出站闸机
		15号线往清华东路西口（終點站）
	岛式站台，左側開门
		15号线往俸伯（北沙滩）
地下三层 站台层		昌平线往昌平西山口（学知园）
	岛式站台，左側開门
		昌平线往西土城（学院桥）

15号线六道口站设2个分离式站厅，分别位于学院路口东西两侧，站厅南侧为通往昌平线站厅的换乘通道。

昌平线六道口站的站厅位于学院路口南侧。

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  15号线西站厅
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  六道口站昌平线站厅

六道口站15号线站台为岛式站台，位于清华东路地底，站台中跨建筑高度为6.6米[6]，拱顶上装有数台吊灯。通往站厅的升降电梯位于站台最西端。

昌平线站台亦为岛式站台。

站台全景（2018年1月摄）

六道口站设有7个出入口，其中D口与15号线西站厅和昌平线站厅均有通道连接。

编号	指示	建议前往的目的地	图片	无障碍设施
连通 15号线站厅
	清华东路（北侧）	六所大厦、北京林业大学		不適用
	学清路（西侧）			不適用
	学清路（东侧）	金码大厦、中国银行、中国农业大学东校区		不適用
	清华东路（南侧）	富润家园、石油大院
连通 15号线 昌平线站厅
	清华东路（南侧）	艺海大厦、中国矿业大学（北京）学院路校区
连通 昌平线站厅
	学院路（东侧）	富润家园、石油大院
	学院路（西侧）	中国矿业大学（北京）学院路校区		不適用
註︰ 設有

本站换乘通道内部的一处曲面墙壁装饰有壁画《繁花似锦》，昌平线车站站厅及换乘端头则装饰有体现“树木与树人”的艺术品《生长》[7]。