噶玛噶举派

黑帽系為噶玛噶举派最主要的支系。1256年（元宪宗6年），蒙哥賜給杜松虔巴再傳弟子噶玛拔希一頂金邊黑色僧帽與一枚金印，其法嗣传承因此得名“黑帽系”，活佛被尊稱為噶瑪巴。噶玛拔希圓寂后被追認爲杜松虔巴轉世，即黑帽系第二世活佛。自第五世噶玛巴·德新谢巴被明成祖封为“大宝法王”后直到明末，历代黑帽系活佛均承袭“大宝法王”封号，傳承至今已至第十七世噶玛巴·伍金赤列多吉。

第三世噶玛巴·让炯多杰弟子扎巴僧格曾從元朝皇室獲賜一頂紅色僧帽，故其法嗣传承得名“紅帽系”，活佛稱夏玛巴。1333年（元統元年）,扎巴僧格建立乃囊寺作为根本道场传法授徒。1490年（弘治4年），第四世夏玛巴·却扎益西建立羊八井寺，此後羊八井寺成为红帽系主寺。红帽系活佛传承至第十世夏玛巴·却朱嘉措时，因其勾结廓尔喀统治者发兵入侵后藏，被清军击败，却朱嘉措自杀，羊八井寺等红帽系寺院被查抄，僧人皆被勒令改宗格鲁派，乾隆帝下令不准却朱嘉措转世，红帽系自此绝传。

巴俄活佛傳承源于乃朗寺，活佛稱巴吾活佛。巴俄系以拉隆寺为主寺，第五世达赖喇嘛时期，拉隆寺改宗格鲁派，该活佛系统恢复乃囊寺为主寺。第二世巴吾活佛巴俄·祖拉陈瓦著有藏史巨著《贤者喜宴》；至第九世巴俄活佛后，该系传承再未见史料记载。

司徒系源于噶玛噶举派祖寺噶玛丹萨寺。1407年，第五世噶瑪巴之徒丘吉嘉称進京覲見明成祖，受賜黑色僧帽與水晶印璽，受封广定大司徒，得号灌顶圆通妙济国师，自此其法嗣傳承稱爲大司徒巴。1727年（雍正5年），第五世大司徒巴却吉嘉岑帕桑修建八邦寺后，司徒派遂以该寺为主寺，法嗣延续至今已至第十二世大司徒巴·贝玛东由宁杰旺波[4]。

贾曹系源于楚布寺黑帽系，后形成贾曹转世系统，法嗣传承至今。