民間司法改革基金會

王隆昌案是一件民間司法改革基金會認定的一件冤案。王隆昌2003年在國立台北科技大學土木與防災研究所擔任教授期間被聘為南港展覽館工程案17位評審委員之一。過不久，扁案爆發，台灣的法務部組成特別偵察組介入調查，並且在沒有查扣帳冊、沒有提出監聽譯文、沒有查到通聯記錄、沒有提出異常金流證明的情況下，僅憑藉著南港展覽館工程案得標廠商的一位高層助理的說詞，就起訴王隆昌。法官採信檢察官的起訴書內容，判處王隆昌7年8個月有期徒刑。[2]

發現有檢察官「初學習電腦製作書類，打字緩慢。」為由向上訴人解釋超時回函的問題。[3]

民間司法改革基金會認為當前台灣的檢察官權力過大，好處是，檢察官能獨立辦案不受干涉，缺點是，檢察官辦案幾乎不受任何節制，辦案的品質全憑檢察官的個人良心來維持。[4]，而也有檢察官涉及貪污的情形，因此推動訂定《檢察官法》，作為檢察官的行為指引[5]。

接受民眾檢舉，將開庭態度不佳，一年內對被告多次惡言相向的台北地檢署檢察官林冠佑提送評鑑。後來監察院彈劾林冠佑[6]。除此之外，民間司法改革基金會也長期接受民眾申訴在台灣檢察、司法體系中遭遇到的不公，並協助伸張正義。