國立海洋生物博物館

• 館長
  • 副館長

部門

• 企劃研究組
• 生物馴養組
• 科學教育組
• 展示組
• 工務機電組
• 秘書室
• 主計室
• 人事室
• 產學合作中心（任務編組）
• 圖書館暨多媒體出版中心（任務編組）
• 經營團隊：海景世界企業股份有限公司

• 海洋生物博士班（Ph.D. in Marine Biology）
• 碩士班海洋生物科技組（M.S. in Marine Biotechnology）
• 碩士班海洋生物多樣性及演化組（M.S. in Marine Biodiversity & Evolutionary Biology）

館區大廳，售票處設於此。

該區域廣納珊展示了從淺水區到深海的不同珊瑚礁棲息地。顯示基於海深、壓力、地形和光線的不同環境。其中設有海底隧道之區域。該隧道長約81公尺，曾經是亞洲最長的海底隧道，目前這個紀錄已經被中國大陸上海海洋水族馆（長155公尺）所超越。

展出的動物包括黑鰭鯊、獅子魚、海鰻、牛鼻鰩、鼻魚、蝴蝶魚和花園鰻。白鯨被安置在一個帶有隧道的展覽館中。

廣納以台灣水域生態生物為主題的大洋池，其壓克力觀景窗有16.5公尺寬、4.85公尺高，池邊壓克力厚度約有33公分厚，其內曾豢養三尾鯨鯊及一尾鬼蝠魟[2]。

潮間帶展覽區設有以海洋無脊椎動物為特色的觸摸池。在此展出的動物包括羅非魚、日本鰻鱺、鱒魚、墨魚、护士鲨、大海鰱、黄鳍金枪鱼、雪花鴨嘴燕魟等物種。

該設施於2006年4月28日完工開放，主要項目包括四大展區：古代海洋、海藻森林、深海水域、極地水域。除海藻森林以傳統之水族缸展示外，首創電子生態缸展示，以虛擬實境手法呈現古代海洋、深海、極地等生態環境。

2023年12月，臺灣首件藍鯨骨骼標本在此進行展出[3]，該幼年藍鯨於2020年1月在臺東縣長濱鄉海灘發現，因身軀遭受漁網繩纏繞，長期無法進食導致死亡，遺體則交由海洋生物博物館、海洋委員會海洋保育署及國立成功大學鯨豚研究中心簽署合作備忘錄，歷時3年製作骨骼標本作為研究典藏並公開展出。[4][5]

其他空間

• 行政中心
• 第一研究大樓：標本典藏室
• 第二研究大樓：國立東華大學海洋生物學研究所
• 水族實驗中心
  • 墾丁天文台
• 學員宿舍

• 
  遊客中心
• 
  臺灣水域館
• 
  世界水域館
• 
  鯨魚親水廣場
• 
  太平洋親水廣場
• 
  建館紀功碑

2014年12月22日，《自由時報》報導，2009年開始，海生館研究團隊參與中國大陸南極團隊研究，曾至南極中國大陸長城站進行科學調查。2014年進行研究時，穿上中國大陸南極考察隊制服，中國國家海洋局核准18項科考項目中，國際研究項目中只有土耳其，中華民國未被承認。前台灣南極學會秘書長李後進批評此舉影響主權，在台灣引起是否降低國格的爭議。海生館研究員宋秉鈞認為，參與中國大陸調查隊的活動，才能獲得較大範圍的科學研究自由，參加中國大陸研究團隊可獲後勤支援，並有研究主導權。但該報仍批評，「海生館此舉已成為中華人民共和國統戰的宣傳，百度百科與媒體均大肆報導」[6]。

2014年12月22日，教育部終身教育司副司長李毓娟表示，中華民國從2009年開始展開極地考察，因自己沒有研究站，在寒天凍地下自負輸運物資非常辛苦，因此和各國一樣採取合作機制；北極工作站合作國家包括美國、德國、法國等，南極工作站合作國家則包括泰國、澳洲、中華民國、中華人民共和國等，中華民國只是用中國大陸工作站的其中一個國家，各國共享研究成果，且海生館發言都用「國立海洋生物博物館」，並無自降國格；南極工作站是由中國大陸設置，所有參與研究的12國工作人員都穿一樣的制服，若有管理階層到工作站，所有參與的研究人員都會互相支援；而台灣的極地研究並未拿教育部經費，預算是由民間企業贊助[7]。民主進步黨立法委員鄭麗君批評，海生館經費六成來自教育部的公務預算，研究人員領的是台灣人民納稅錢，卻自我認同嚴重混淆，自甘被中國大陸矮化、吃豆腐。民主進步黨立法委員陳亭妃說，台灣透過國際合作模式參與其他國家的任何研究，不會有人阻止，也沒有矮化的問題；「南極研究為何非中國不可？說不過去」，她會要求海生館到立法院報告，如果確有遭矮化情事發生，她將要求懲處相關失職人員[8]。