肠球菌

腸球菌是一種移生在腸道的革蘭氏陽性菌，故名腸球菌。在19世紀末發現，早期歸為鏈球菌屬。1930年代中期，依蘭斯菲爾德血清分型（Lancefield classification），腸球菌被歸類為D群鏈球菌（Group D Streptococcus），但是與非腸球菌的D群鏈球菌，如Streptococcus bovis， 在生化特性上有相當大的差異。直到1984年，基因體DNA分析指出腸球菌和鏈球菌的不同，而將腸球菌獨立成為一屬。[8]

肠球菌属目前含40个种，临床常见的包括：[9]

• Enterococcus alcedinis Frolková et al. 2013
• 海水肠球菌 Enterococcus aquimarinus Švec et al. 2005
• 驴肠球菌 Enterococcus asini de Vaux et al. 1998
• 鸟肠球菌 Enterococcus avium (ex Nowlan and Deibel 1967) Collins et al. 1984
• Enterococcus bulliens Kadri et al. 2016
• Enterococcus caccae Carvalho et al. 2006
• Enterococcus camelliae Sukontasing et al. 2007
• Enterococcus canintestini Naser et al. 2005
• 犬肠球菌 Enterococcus canis De Graef et al. 2003
• 铅黄肠球菌 Enterococcus casseliflavus (ex Vaughan et al. 1979) Collins et al. 1984[10]
• 盲肠肠球菌 Enterococcus cecorum (Devriese et al. 1983) Williams et al. 1989
• 鸽肠球菌 Enterococcus columbae Devriese et al. 1993
• Enterococcus crotali McLaughlin et al. 2017
• 戴维斯肠球菌 Enterococcus devriesei Švec et al. 2005
• Enterococcus diestrammenae Kim et al. 2013
• 殊异肠球菌 Enterococcus dispar Collins et al. 1991
• Enterococcus dongliensis Li and Gu 2019
• 耐久肠球菌 Enterococcus durans (ex Sherman and Wing 1937) Collins et al. 1984
• Enterococcus eurekensis Cotta et al. 2013
• 粪肠球菌 Enterococcus faecalis (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984
• 屎肠球菌 Enterococcus faecium (Orla-Jensen 1919) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984
• 黄色肠球菌 Enterococcus flavescens Pompei et al. 1992，异名
• Enterococcus florum Techo et al. 2019
• 鹑鸡肠球菌 Enterococcus gallinarum (Bridge and Sneath 1982) Collins et al. 1984
• 浅黄肠球菌 Enterococcus gilvus Tyrrell et al. 2002
• 血过氧化物肠球菌 Enterococcus haemoperoxidus Švec et al. 2001
• 赫尔曼肠球菌 Enterococcus hermanniensis Koort et al. 2004
• 小肠肠球菌 Enterococcus hirae Farrow and Collins 1985，海氏肠球菌
• Enterococcus hulanensis Li and Gu 2019
• 意大利肠球菌 Enterococcus italicus Fortina et al. 2004
• Enterococcus lactis Morandi et al. 2012
• Enterococcus lemanii Cotta et al. 2013
• 病臭肠球菌 Enterococcus malodoratus (ex Pette 1955) Collins et al. 1984
• 莫拉维亚肠球菌 Enterococcus moraviensis Švec et al. 2001
• 蒙特肠球菌 Enterococcus mundtii Collins et al. 1986
• Enterococcus nangangensis Li and Gu 2019
• Enterococcus olivae Lucena-Padrós et al. 2014
• 亮黄肠球菌 Enterococcus pallens Tyrrell et al. 2002
• 木戴胜鸟肠球菌 Enterococcus phoeniculicola Law-Brown and Meyers 2003
• 平房肠球菌 Enterococcus pingfangensis Li and Gu 2019
• Enterococcus plantarum Švec et al. 2012
• 猪肠球菌 Enterococcus porcinus Teixeira et al. 2001，异名
• 假鸟肠球菌 Enterococcus pseudoavium Collins et al. 1989
• Enterococcus quebecensis Sistek et al. 2012
• 棉子糖肠球菌 Enterococcus raffinosus Collins et al. 1989
• 鼠肠球菌 Enterococcus ratti Teixeira et al. 2001
• Enterococcus rivorum Niemi et al. 2012
• Enterococcus rotai Sedláček et al. 2013
• 解糖肠球菌 Enterococcus saccharolyticus (Farrow et al. 1985) Rodrigues and Collins 1991
• 少糖肠球菌 Enterococcus saccharominimus Vancanneyt et al. 2004，异名
• Enterococcus saigonensis Harada et al. 2016
• Enterococcus seriolicida Kusuda et al. 1991，异名
• Enterococcus silesiacus Švec et al. 2006
• Enterococcus solitarius Collins et al. 1989，异名
• Enterococcus songbeiensis Li and Gu 2019
• 硫磺肠球菌 Enterococcus sulfureus Martinez-Murcia and Collins 1991
• Enterococcus termitis Švec et al. 2006
• 泰国肠球菌 Enterococcus thailandicus Tanasupawat et al. 2008
• Enterococcus ureasiticus Sistek et al. 2012
• Enterococcus ureilyticus Sedláček et al. 2013
• Enterococcus viikkiensis Rahkila et al. 2011
• 肠绒毛肠球菌 Enterococcus villorum Vancanneyt et al. 2001
• Enterococcus wangshanyuanii Jin et al. 2017[11]
• 香坊肠球菌 Enterococcus xiangfangensis Li et al. 2014，以哈尔滨市香坊的地名命名
• 新疆肠球菌 Enterococcus xinjiangensis Ren et al. 2020

腸球菌在顯微鏡下典型的排列為成對或短鏈狀，很難與肺炎鏈球菌區別。腸球菌是兼性厭氧菌，可在有氧和無氧的環境中生長[12]。 雖然腸球菌不能形成孢子，但他們對於生長環境卻有很高的耐受性，例如可在下列環境中生長：溫度10-45℃、酸鹼度pH 4.5-10.0、高鹽濃度6.5%NaCl或40%膽汁[13]。最適宜生長溫度為35℃，24小時培養可以形成白色菌落。

腸球菌在臨床上引起的重要感染包括泌尿道感染、菌血症、心內膜炎、憩室炎和腦膜炎等[13][14] 。敏感性菌株的感染可用氨苄青黴素（ampicillin）、青黴素（penicillin）和萬古黴素（vancomycin）治療[15]。 泌尿道感染則可用呋喃妥因（nitrofurantoin）進行特異性治療，即使在萬古黴素抗藥性的情況下[16]。

從醫學觀點來看，腸球菌的一個重要特性是具有高度的先天抗藥性。一些腸球菌對β-內醯胺類抗生素（β-lactam，如青黴素、頭孢菌素（cephalosporin）、碳青黴烯（carbapenem）及許多氨基糖苷類抗生素（aminoglycoside）具有抗藥性[14]。尤其是過去20多年來，抗萬古黴素腸球菌（Vancomycin-Resistant Enterococcus，VRE）在院內感染患者逐漸被檢出，尤其是在美國[13]。抗萬古黴素腸球菌可用奎奴普丁/達福普丁（quinupristin/dalfopristin）來治療，約有70％的患者會達到治療效果[17]，若與去氧羥四環素（doxycycline）合併治療，可降低抗藥性發生的機會。老虎黴素類抗生素（tigecycline）也已證明能用來治療腸球菌感染[18]。

2008年的一研究分析了歐洲各國（北歐、英國、愛爾蘭、法國、中歐、南歐、東歐、荷蘭）抗萬古黴素腸球菌的發生與流行，並對臨床上預防抗萬古黴素腸球菌的方式提出建議。此篇文獻認為，E. faecium的氨苄青黴素（ampicillin）抗藥性可做為抗萬古黴素腸球菌風險一個很好的篩檢方法；對於分析E. faecium的基因差異（如esp基因、pruK基因）則屬次要的方式，因為這些基因學的特徵並非在所有抗氨苄青黴素（ampicillin）的E. faecium皆有一致的表現。也就是說，若沒有檢測出這些基因變異，並不能證明E. faecium菌株不會有擴散或導致疾病的風險[19]。世界衛生組織（WHO）在2017年初將抗萬古黴素腸球菌列為「高度威脅」的致病菌[20]。

腸球菌性腦膜炎是神經外科上罕見的併發症。它一般需要透過靜脈或鞘內萬古黴素來進行治療，但是治療效果仍有爭議[21]。新的流行病學證據顯示，腸球菌亦是慢性細菌性攝護腺炎的主要感染因子，腸球菌會在攝護腺中形成生物膜，使其難以治療。

除了抗藥性，腸球菌也會生成許多毒性因子，毒性因子是作用於人體且會引發許多病灶，甚至造成嚴重疾病的物質；這些因子皆增加了腸球菌對人體的致病力[22][23][24]。

美國國家院內感染監視系統（NNIS）所建置的國家健康照護安全網路（NHSN）[25]統計發現，腸球菌是院內感染的第二大病原菌[26]，且位居醫療照護相關血液感染比例的第三位[27]，顯示腸球菌抗藥性所隱藏的致病風險。

目前腸球菌應用於醫藥級的藥用益生菌（pharmaceutical probiotics）主要在歐洲與亞洲部分國家通過上市。市面上以屎腸球菌（E. faecium）作為藥用益生菌的安全菌株，主要源自於瑞士原料藥廠Cerbios-Pharma SA所研發的Enterococcus faecium SF68®（cernelle 68）菌株。德國、台灣與日本的藥廠則多半以糞腸球菌（E. faecalis）研發安全菌株製成藥用的益生菌。

目前歐洲食品安全局規定腸球菌E. faecium使用在動物飼料，須通過相關的安全評估，包括了不得檢出三種毒性因子和DNA標記：IS16、Esp、hyl-like，以及氨苄青黴素（ampicillin）的最低抑菌濃度（MIC）不得超過2 mg/L，若不符合上述的檢驗標準，則認定為不安全，此腸球菌不可使用於飼料添加物當中[78]。

水質中的腸球菌標準非常嚴格，例如在夏威夷州和美國的大部分地區，其海灘周圍的水域是每100毫升水中，五個星期的平均值不得超過35菌落形成單位（CFU）的腸球菌，否則該地區可能會發布警告，要求民眾遠離海灘[79]。2004年，腸球菌更取代了糞大腸菌群和大腸桿菌，成為新的美國聯邦公共鹽水和淡水海域水質標準[80]。

中華民國的海灘水質也是參考香港及美國，主要以甲類海域之海洋環境品質標準—大腸桿菌群之菌落數在1000 CFU/100mL以下（以下簡稱「符合甲類」）為判定依據。符合甲類者，再以腸球菌群區分為「優良」或「普通」。當大腸桿菌群 ≦ 1000 CFU/100mL，且腸球菌群 ≦ 50 CFU/100mL，水質標準為「優良」。當大腸桿菌群 ≦1000 CFU/100mL，但腸球菌群＞50 CFU/100mL，水質標準為「普通」。若大腸桿菌群＞1000 CFU/100mL，則「不宜親水活動」 [81]。

腸球菌通常會在羊血瓊脂（sheep's blood agar）上呈現γ-溶血反應[14]。