虫囊菌科

本科包括以下属：

• Acallomyces Thaxter
• 无雅菌属 Acompsomyces Thaxter
• Acrogynomyces Thaxter, 1931
• 无形菌属 Amorphomyces Thaxter, 1893
• Amphimyces Thaxter
• Apatelomyces Thaxter, 1931
• Apatomyces Thaxter, 1931
• Aphanandromyces W.Rossi
• 无孔菌属 Aporomyces Thaxter, 1931
• Appendiculina Berl.
• Arthrorhynchus Kolen.
  • Arthrorhynchus acrandros Merola
  • Arthrorhynchus cyclopodiae Thaxt.
  • Arthrorhynchus eucampsipodae Thaxt.
  • Arthrorhynchus nycteribiae (Peyr.) Thaxt.[2]
• Asaphomyces Thaxter
• Autophagomyces Thaxter
• Balazucia R.K.Benjamin, 1968
• Benjaminiomyces I.I.Tavares, 2000
• 顶囊菌属 Blasticomyces I.I.Tavares, 1985
• Bordea
• 葡雄菌属 Botryandromyces I.I.Tav. & T.Majewski
• Camptomyces Thaxter
• 间雄菌属 Cantharomyces Thaxter
• Capillistichus S.Santamaría, 2004
• Carpophoromyces Thaxter, 1931
• Ceraiomyces
• Cesariella W.Rossi & S.Santamaria, 2008
• 牙甲菌属 Chaetarthriomyces Thaxter
• Chaetomyces Thaxter, 1893
• 甲壳菌属 Chitonomyces Peyr.
• Clematomyces Thaxter, 1900
• Clonophoromyces Thaxter, 1931
• Columnomyces R.K.Benjamin, 1955
• Compsomyces Thaxter
• 翅托菌属 Coreomyces Thaxter
• Coreomycetopsis Thaxter, 1920
• 帚菌属 Corethromyces Thaxter
• Corylophomyces R.K.Benjamin, 1994
• 隐雄菌属 Cryptandromyces Thaxter
• Cucujomyces Spegazzini, 1917
• Cupulomyces R.K.Benjamin, 1992
• Dermapteromyces Thaxter, 1931
• Diandromyces Thaxter, 1918
• Diaphoromyces Thaxter, 1926
• Dichomyces Thaxter
• Diclonomyces Thaxter, 1931
• 排壳菌属 Dimeromyces Thaxter
• Dimorphomyces Thaxter
• Dioicomyces Thaxter
• Diphymyces I.I.Tav.
• Diplomyces Thaxter
• Diplopodomyces W.Rossi & Balazuc, 1977
• Dipodomyces Thaxter, 1931
• Distichomyces
• Distolomyces Thaxter
• 叉菌属 Dixomyces I.I.Tavares, 1985
• Ecteinomyces Thaxter
• 同株菌属 Enarthromyces Thaxter, 1896
• 复雄菌属 Eucantharomyces Thaxter, 1895
• Eudimeromyces
• Euhaplomyces Thaxter
• Eumisgomyces
• 真单体菌属 Eumonoicomyces Thaxter, 1901
• Euphoriomyces Thaxter
• Fanniomyces T.Majewski, 1972
• 丝菌属 Filariomyces Shanor, 1952
• Gloeandromyces Thaxter, 1931
• 单菌属 Haplomyces Thaxter
• Hesperomyces Thaxter
• Histeridomyces Thaxter, 1931
• Homaromyces R.K.Benjamin, 1955
• 沼梭菌属 Hydraeomyces Thaxter
• Hydrophilomyces Thaxter
• Idiomyces Thaxter
• Ilyomyces F.Picard, 1917
• Ilytheomyces Thaxter, 1917
• Jeaneliomyces
• 新菌属 Kainomyces Thaxter, 1901
• Kleidiomyces Thaxter, 1908
• Kruphaiomyces Thaxter, 1931
• Kyphomyces I.I.Tavares, 1985
• 虫囊菌属 Laboulbenia Mont. & C.P.Robin, 1853
• Laboulbeniella
• Limnaiomyces Thaxter, 1900
• Majewskia Y.-B.Lee & K.Sugiyama, 1986
• Meionomyces Thaxter, 1931
• Microsomyces Thaxter, 1931
• Mimeomyces Thaxter, 1912
• 顶枝菌属 Misgomyces Thaxter
• Monandromyces R.K.Benjamin, 1999
• 单体菌属 Monoicomyces Thaxter
• Nanomyces Thaxter, 1931
• Neohaplomyces R.K.Benjamin, 1955
• Nycteromyces Thaxter, 1917
• 链菌属 Ormomyces I.I.Tavares, 1985
• 隐翅甲菌属 Osoriomyces K.Terada, 1981
• Parahydraeomyces
• Parvomyces S.Santamaria, 1995
• Peyerimhoffiella Maire, 1916
• 多精菌属 Peyritschiella Thaxter
• Phalacrichomyces R.K.Benjamin, 1992
• Phaulomyces Thaxter
• Picardella I.I.Tavares, 1985
• 多雄菌属 Polyandromyces Thaxter, 1920
• Polyascomyces Thaxter
• 具孔菌属 Porophoromyces Thaxter, 1926
• Prolixandromyces R.K.Benj., 1970
• Pselaphidomyces Spegazzini, 1917
• 刺菌属 Rhachomyces Thaxter
• Rhadinomyces Thaxter
• Rheophila
• Rhipidiomyces Thaxter, 1926
• Rhizomyces Thaxter, 1896
• Rhizopodomyces Thaxter, 1931
• 虫生菌属 Rickia Cavara
• Rossiomyces R.K.Benj.
• Sandersoniomyces R.K.Benjamin, 1968
• Scalenomyces I.I.Tavares, 1985
• Scaphidiomyces Thaxter, 1912
• Scelophoromyces Thaxter, 1912
• Scepastocarpus S.Santamaría, 2004
• Schizolaboulbenia
• Siemaszkoa I.I.Tav. & T.Majewski
• Smeringomyces Thaxter, 1908
• Sphaleromyces Thaxter
• Spongiophaga Carter, 1878
• Stemmatomyces Thaxter, 1931
• Stichomyces Thaxter
• 点菌属 Stigmatomyces H.Karst.
• Sugiyamaemyces I.I.Tavares & J.Balazuc, 1989
• Symplectromyces Thaxter
• Sympodomyces R.K.Benjamin, 1973
• 聚雄菌属 Synandromyces Thaxter, 1912
• Tavaresiella T.Majewski, 1980
• 怪菌属 Teratomyces Thaxter
• Tetrandromyces Thaxter, 1912
• Thaxterimyces
• Trenomyces Chatton & F.Picard
• Triainomyces W.Rossi & A.Weir, 1998
• Triceromyces T.Majewski, 1980
• Trochoideomyces Thaxter, 1931
• Troglomyces S.Colla
• 对雄菌属 Zeugandromyces Thaxter, 1912
• 大托菌属 Zodiomyces Thaxter