鄭文燦

在吳志揚時期動工的桃園鐵路高架化工程，突然被鄭文燦以民意希望地下化為由中止，並開始規劃鐵路地下化。遭批手段野蠻粗暴，不但使工程經費從308億暴增至945億（後增至1047億），還延後了鐵路立體化完工日期，並引發桃園鐵路是否需要地下化的爭論。之後鄭文燦表示將學習京都車站的做法為樣本，完成車站與鐵路的地下共構設計，打造北部都市圈最西的桃園地標。[15]但京都車站為平面與高架車站，沒有地下月台與軌道。預計2020年地下化工程動工。[16]完工日期則從2025延後至2026，被議員質疑政策跳票。[17]新北市政府也因完工遙遙無期，設法讓鳳鳴車站與桃園鐵路地下化工程脫鉤，於2025年如期啟用[18]。

2022年9月18日，臺東縣池上鄉發生芮氏規模6.8強震，桃園市震度為3級。啟用約一年的八德國民運動中心五樓的羽球場在地震時天花板輕鋼架及隔音板倒塌掉落[19]，幸好現場使用羽球場的民眾迅速逃生傷亡。後承包該工程標案的瑞助營造，被揭發經年發生工安意外，且自2015年以來，該承包商共違反職安法令達199次[20]。隨後鄭文燦因為豆腐渣工程挨批，連夜出面道歉。[21][22]

2022年10月3日，新黨桃園市議員參選人游智彬和新黨發言人陳麗玲，公開質疑桃園市市長鄭文燦在國立臺灣大學國家發展研究所（國發所）碩士論文涉嫌抄襲，甚至可能並非鄭文燦自寫，而是由論文工廠（或槍手）捉刀代寫。游智彬稱鄭文燦的《中國基層選舉演變之分析——尋找民主發展的動力》，大量引用中國大陸資料，導致臺灣的「相似性比對軟體」不易查核，游智彬等人透過中國大陸的論文比對系統查核，發現30.27%的文字涉嫌抄襲，像是論文第40頁內容整段引自《從村長選舉制度和實態看中國的住民自治—以四川省調查事例為中心》一文，還沒有加註出處；另224個參考文獻中，有多處未在論文本文中出現。且鄭文燦論文有大量排序錯亂與文字前後不統一等問題，像後半段所有「國立」二字全部消失，推測後半部分是引用中國大陸書籍，該書因政治正確而刪去「國立」2字；而有的中文書目沒有作者及文章名，其實是引自同一本書，但鄭文燦並未標示出處[13]。

2022年12月2日，台大社會科學院學術倫理委員會（學倫會）決定撤銷鄭文燦的台大國發所碩士論文，取消其碩士學位，同時決議不再續聘該論文指導教授陳明通，永不錄用[23]。

鄭文燦坦承自己的論文有許多疏忽之處，當時交稿時間緊迫，於是先寫內文，加上參考的書籍未在手上，故未能將參考資料一一標明，且當時沒有比對系統可參考，導致疏失。鄭願意接受裁定，並針對論文瑕疵，兩次表示歉意，但直言沒抄襲意圖。林佳龍當時擔任鄭文燦口試委員之一，林佳龍幕僚表示，比對研究生論文是指導教授工作，口試委員通常是指正研究方法的重大謬誤。[24]

2023年1月，鄭文燦、林佳龍，陳建仁出席彰化縣百工百業信賴總會，鄭文燦表示「如果這個地方的焚化爐已經夠多了，要求經濟部就要檢討其必要性，朝解除契約的方向來走」[25]。

2024年3月18日，民眾黨立委黃國昌揭露，中華足協每年拿國家上億的補助，選手們卻被足協欠款不還，連前年的錢還都拖欠，並直指事發時，足協理事長為現任行政院副院長鄭文燦、秘書長是現任體育署長鄭世忠[26]。黃國昌指早前接到投訴，稱2022年12月中華男足對泰國國際友誼賽，直到現在2024年，連球員的出場費、集訓費、車馬費都還沒給；時任理事長鄭文燦當時還說，球隊睽違3年半首勝、要發30萬獎金鼓勵全隊，結果到現在國腳們一毛都沒有拿到，甚至有球員還未收到出國補助款，就收到足協發出的扣繳憑單[26]。

黃國昌3月20日在財政委員會針對財政部長莊翠雲進行質詢時，針對足球國家隊球員明明沒有收到錢，卻收到中華足協給的扣繳憑單，對此產生質疑。莊翠雲回應，這個案子北區國稅局也有在查，北區國稅局長李怡慧則表示，新莊稽徵所已經發函要求足協說明扣繳稅款是否有誤，並希望於4月2日前回答[27]。

足協3月20日坦承疏失，指是行政疏失。黃國昌在臉書發文痛批，足協此舉擺明就是知道紙包不住火，趕緊出來幫行政院副院長鄭文燦洗地，並指出足協在聲明已經承認，當初造假的扣繳憑單是由時任秘書長、現任體育署長鄭世忠經手處理[28][29]。