DNA错配修复

DNA错配修复(DNA mismatch repair,簡稱MMR)是生物DNA修復的一種機制,可修補DNA中配對錯誤的鹼基[1][2]。因錯配通常發生在新合成的DNA中(可能為鹼基發生互變異構所致),進行錯配修復時細胞需識別哪一股DNA為新合成者(參見半保留複製),並將其鹼基切除修復,在許多細菌中舊的DNA一般有被甲基化,新合成的DNA則無,故細胞可以此識別新股,其他細菌與真核生物中的識別機制則有所不同,在真核生物中可能是以DNA剛複製後遲滯股(lagging strand)上尚未被連接酶連接的切口識別(且領先股上可能也會有切口)[3]

DNA错配修复途徑示意圖,左為真核生物,中間為多數細菌,右為大腸桿菌與部分細菌

大腸桿菌的DNA错配修复過程為MutS蛋白二聚體(MutS2)與新合成DNA上配對錯誤的鹼基結合,接著MutL2會與之結合,MutH則切割錯配附近未被甲基化的GATC位點而造成切口,之後MutS2、MutL2與MutH組成的複合體從切口處往錯配處方向移動,過程中UvrD解旋酶可將DNA的兩股分開,並有外切酶可水解新股DNA(包含錯配的鹼基)[註 1],直到經過錯配的鹼基後才停止,最後DNA聚合酶與DNA連接酶可重新合成被移除的DNA序列[4]。真核生物DNA错配修复的過程與原核生物相似,大部分蛋白均與後者的同源,但不同於大腸桿菌的MutS2與MutL2為同源二聚體,真核生物的均為異源二聚體[4],其中MutLα可能具內切酶功能[5]。除上述蛋白外修復過程還有PCNA[6][7]RPARFCHMGB1DNA聚合酶δ等蛋白參與[4],有依賴外切酶Exo1的途徑,也有使用其他蛋白切除錯配DNA的途徑[8]

DNA錯配修復的異常與多種疾病相關,Mut蛋白的突變會造成微衛星不穩定,可導致多種癌症,例如遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)即為MSH2MLH1等基因突變所致[9],單一基因突變即可致病,兩個Mut蛋白的基因皆突變則可能導致透克氏症(错配修复癌症症候群,CMMR-D),常出現早發的結腸癌腦癌[10]。除Mut蛋白的DNA序列突變外,啟動子甲基化表觀遺傳修飾與miR-155過度表現等機制也會因降低這些蛋白的表現而抑制DNA錯配修復,進而導致癌症[11] [12]

註腳

  1. 外切酶種類隨MutH切割的相對位置而異,若切割位點在錯配鹼基的5端,則會使用RecJ或ExoVII等由5端至3端水解的外切酶,反之則使用ExoI或ExoX等由3端至5端水解的外切酶[4]

參見

參考文獻

  1. Iyer RR, Pluciennik A, Burdett V, Modrich PL. . Chemical Reviews. February 2006, 106 (2): 302–23. PMID 16464007. doi:10.1021/cr0404794.
  2. Larrea AA, Lujan SA, Kunkel TA. . Cell. May 2010, 141 (4): 730–730.e1. PMID 20478261. doi:10.1016/j.cell.2010.05.002.
  3. Heller RC, Marians KJ. . Nature Reviews. Molecular Cell Biology. December 2006, 7 (12): 932–43. PMID 17139333. doi:10.1038/nrm2058.
  4. Li GM. . Cell Res. 2008, 18 (1): 85–98. PMID 18157157. doi:10.1038/cr.2007.115.
  5. Kadyrov FA, Dzantiev L, Constantin N, Modrich P. . Cell. 2006, 126 (2): 297–308. PMID 16873062. doi:10.1016/j.cell.2006.05.039.
  6. Pluciennik A, Dzantiev L, Iyer RR, Constantin N, Kadyrov FA, Modrich P. . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. September 2010, 107 (37): 16066–71. PMC 2941292可免费查阅. PMID 20713735. doi:10.1073/pnas.1010662107.
  7. Kadyrov FA, Dzantiev L, Constantin N, Modrich P. . Cell. July 2006, 126 (2): 297–308. PMID 16873062. doi:10.1016/j.cell.2006.05.039.
  8. Goellner EM, Putnam CD, Kolodner RD. . DNA Repair (Amst). 2015, 32: 24–32. PMC 4522362可免费查阅. PMID 25956862. doi:10.1016/j.dnarep.2015.04.010.
  9. Ring, Kari L.; Garcia, Christine; Thomas, Martha H.; Modesitt, Susan C. . American Journal of Obstetrics and Gynecology. 2017, 217 (5): 512–521 [2021-05-07]. ISSN 1097-6868. PMID 28411145. doi:10.1016/j.ajog.2017.04.011. (原始内容存档于2021-05-12).
  10. OMIM 276300
  11. Truninger K, Menigatti M, Luz J, Russell A, Haider R, Gebbers JO, et al. . Gastroenterology. May 2005, 128 (5): 1160–71. PMID 15887099. doi:10.1053/j.gastro.2005.01.056.
  12. Valeri N, Gasparini P, Fabbri M, Braconi C, Veronese A, Lovat F, et al. . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. April 2010, 107 (15): 6982–7. PMC 2872463可免费查阅. PMID 20351277. doi:10.1073/pnas.1002472107.
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