黃鼠冠狀病毒HKU24
中國鼠冠狀病毒HKU24（China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24）是乙型冠狀病毒屬的一種病毒，在香港與廣州的大鼠腸道中被發現，於2015年由香港大學的研究人員發表[1]。
黃鼠冠狀病毒HKU24 | |
|---|---|
病毒分類  | |
| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
| 种： | 黃鼠冠狀病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24 |
基因組
中國鼠冠狀病毒HKU24的基因組約長31200nt，編碼冠狀病毒皆有的複製酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）與衣殼蛋白（N）等四種結構蛋白，另外還有血細胞凝集素酯酶（HE）以及NS2a、NS4、NS5與N2等四種輔助蛋白，其基因順序為1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N[1]。
演化
序列分析顯示中國鼠冠狀病毒HKU24在乙型冠狀病毒1型（牛冠狀病毒、人類冠狀病毒OC43、豬凝血性腦脊髓炎病毒等）的基部形成一演化支，顯示此病毒可能是乙型冠狀病毒1型（包含兔冠狀病毒HKU14）的姊妹群，和同亞屬中亦感染鼠類的鼠冠狀病毒則關係較遠。此病毒的演化地位顯示可感染多種動物的乙型冠狀病毒1型最早可能是由鼠類病毒演化而來。此病毒與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1等共同組成一演化支支序A（lineage A），此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶（HE），其他冠狀病毒則無[1][2]。
參考文獻
- Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. . Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523
. PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. （原始内容存档于2022-05-13） （英语）. - Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. . Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. （原始内容存档于2022-05-07） （英语）.
In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
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