严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2流行病学溯源

2020年1月14日，武漢市金銀潭醫院副院长黄朝林等近30名中國學者在《刺針》期刊发布论文指，进一步的流行病学调查中，通过综合武汉市医疗体系的全部病例指，一位患者在12月1日已出現癥狀，该名患者是目前已知最早发病的患者。该论文同时指出該患者並没有去過武漢华南海鲜市场，並且與後續病例之間也没有發現流行病學上的關聯[3]。

2020年5月3日，医学期刊《国际抗菌剂杂志》刊登题为《新冠病毒2019年12月底已在法国传播》的论文。研究人员选取14个2019年12月2日至2020年1月16日期间流感疾病（ILI）重症监护室病例，于4月6日至9日重新进行新冠病毒核酸检测，发现一名42岁男子的样本呈阳性，该病例与中国缺乏关联，且在发病前没有外国旅行史。本文认为法国低估了新冠病毒的流行性，在2019年12月下旬此病毒就可能已经在法国传播，且由于无症状感染者占据总感染数字的18-23%，说明在2020年1月有相当数量的无症状感染者没有检出。[4]

在2021年12月的《流行病》杂志上发表的研究成果表明，伦巴第大区在首位确诊病例之前，已有至少527个确诊病例，这些病例分布在伦巴第大区1506个城镇中的222个，涵盖了其所有12个省。该研究的参与者是意大利住院和传染病研究所（IRCSS）、伦巴第大区社会福利委员会预防传染病部门的传染病学家，以及病毒学家。研究采用的方法是，分析官方病例记录、建立实验室确诊病例清单，以及对此前的病例及其密切接触者进行回访等。[5]

据米蘭國家腫瘤研究所2020年11月11日發表的一項研究，研究人員在2019年9月至2020年3月參加肺癌篩檢人士身上取得的959個血液樣本中，尋找冠状病毒棘突蛋白受體結合區特定抗體。結果顯示，意大利在2019年9月採集的居民血液樣本中已測出新冠病毒抗體，這意味着冠状病毒在意大利的傳播時間可能要追溯至2019年夏季。[6]

2020年12月1日，包括来自美国疾病控制与预防中心、美国红十字会在内的科学家，刊登于美国感染病协会杂志《临床传染病》的研究显示[7][8]，在2019年12月13日至2020年1月17日之间收集的九个州7389份居民献血样本中，发现有106份存在新冠病毒抗体，于武汉的首例之前就已经存在。[8][1]同時，該研究文章也指出，樣本中没有一个血清可以被认为是“真正的阳性”，“真正的阳性”只能从分子诊断测试呈阳性或滴度升高的急性-恢复期配对血清中收集[8]。

英国一项基因研究发现，2019年底SARS-CoV-2或已在全球迅速传播，并且仍在反复发生突变以不断适应其人类宿主。这项研究名为《SARS-CoV-2基因组多样性与反复突变的出现》（Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2），于2020年9月在线发表在国际医学期刊《感染、遗传学和进化》（Infection, Genetics and Evolution）上。研究团队主要来自伦敦大学遗传学研究所，通讯作者为该所研究员弗朗索瓦·鲍卢克斯（François Balloux）。研究指出，从系统进化估计来看，SARS-CoV-2大流行开始的时间大概在2019年10月6日至2019年12月11日之间，这也大概是其从自然宿主进入人类社会的时间。[9]

已有很多对新冠早期病例的研究，采用了基于废水的流行病学的方法。巴西、意大利、澳大利亚、英国、丹麦、西班牙等国的多项研究都表明，在社区发现第一例病例之前的样本即已呈现阳性，“废水信号”早于确诊病例的天数最多可达63天。[10]例如，对巴西圣卡塔琳娜州弗洛里亚诺波利斯的一项研究表明，SARS-CoV-2可能在2019年11月就已经在巴西的社区中传播，比美洲报告的首例病例还要早。[11]