万顷沙站

本站共有两层，其中地面为车站各出入口，车站周边为在建的国铁南沙站以及其它建筑；地下一层为站厅，地下二层为站台。

地下一层	站廳	售票機、客服中心、商店、警務室、安檢設施
地下二层	1 站台	18号线 冼村方向（下站：横沥）
	岛式站台（卫生间、母婴室）
	2 站台	18号线 终点站台

站厅

万顷沙站站厅設有自动售票機及智能客務中心[3]。

为方便行人进出，万顷沙站站厅东侧被划分为收费区，收费区内设有多组扶手电梯，楼梯和专用电梯可供乘客前往站台。

1号站台

本站设有一个岛式站台，位于待建的国铁南沙站站房和路轨的地底。本站的卫生间和母婴室设于站台北端。

另外，本站站台北端设有一条渡线，可供列车进行站前折返。南端設有往返万顷沙车辆段的出入段線，出入段線路軌之间设有一組交叉渡線，供初期运营时的所有18號線列車进行折返。同时两侧的正線末端預留往南延伸的條件[4]。

2号站台全景图（摄于2021年9月）

万顷沙站目前设有4个出入口，其中2个出入口可供乘客进出。其中车站东北侧的A、B口在车站启用时同步启用；后于2023年9月11日为配合15号线车站建设而暂时关闭，并同步启用西南侧的C、D口[5]。

編號	设施	照片	出口指示	建議前往的目的地
A				（暂时关闭）
B				（暂时关闭）
C			同安东围路	地铁万顷沙站公交车站（北行）
D			同安东围路	地铁万顷沙站公交车站（南行）
註︰ 設有 |  設有 |  設有 |  設有扶手電梯

根據《粤港澳大湾区（城际）铁路建设规划》，18号线將由万顷沙站继续往南延伸至中山和珠海，屆時万顷沙站將從18号线南端終點站變為中途站[4]。

根據南沙区和广州市的相关规划，15號線將設有萬頃沙站，但18號線設計之初並未預留與15號線的換乘位置[12]。15号线车站总长320米，标准段宽22.5米。其将建于18号线车站东北侧，两线车站呈平行布置，并将通过站厅付费区通道连接[13]。

截至目前，15号线尚未获批，但15号线车站已于2022年3月26日以“南沙站综合交通枢纽地铁预留工程”的名义开建[14]。