三磷酸腺苷合酶

三磷酸腺苷合酶ATP合酶三磷酸腺苷酶(ATPase)的一种,在这里并特指F类的FoF1ATP合酶(F Type FoF1 ATP Synthase)。它利用呼吸链产生的质子电化学势能,通过改变蛋白质的结构来进行三磷酸腺苷(ATP)的合成。ATP是大多数生物体中细胞最常用的“能量通货”。 它由二磷酸腺苷(ADP)和无机磷酸盐(Pi)形成。 ATP合酶催化的总体反应为:

  • ADP + Pi + H+out ATP + H2O + H+in
ATP合酶
通过X射线晶体学测定ATP合酶的分子模型
识别码
EC編號 3.6.3.14
CAS号 9000-83-3
数据库
IntEnz IntEnz浏览
BRENDA BRENDA入口
ExPASy NiceZyme浏览
KEGG KEGG入口
MetaCyc 代谢路径
PRIAM 概述
PDB RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
基因本体 AmiGO / EGO

ATP合酶由两个主要的亚基Fo和F1组成,它们具有允许ATP产生的旋转运动机制[1][2]


分布

通过使用电子显微镜,蘑菇状的F型ATP酶可以在真核细胞粒線体内膜和原核生物細胞膜上观察到。

位置

在真核细胞中,ATP合酶存在于线粒体的内膜,Fo亚单位存在于膜内,F1

  • F型ATP酶(ATPase)– 也称为‘Phosphorylation Factor’存在在各种生物中,利用电化学势进行ATP的合成。
  • P型ATP酶(也称 E1-E2 ATP酶)– 存在在细菌,和真核细胞中,消费ATP进行离子运输。
  • V型ATP酶 – 存在在液泡Vesicle),如高尔基体溶酶体上,消费ATP进行离子运输
  • A型ATP酶 – 存在在古细菌Archaea)中,虽然有F型ATP酶类似的功能——ATP合成,但是在结构上其更接近与V型ATP酶,反映了古细菌为适应极端条件的进化。

结构与功能

当前,原核生物的F型ATP酶的结构已经比较清楚了:

  • F1单元 – α(3个)、β(3个)、γ(1个)、δ(1个)、ε(1个)
  • Fo单元 – a(1个)、b(2个)、c(9-12个)

真核生物的F型ATP酶F1单元的种类的数量与原核生物相同、Fo单元的结构与原核生物相似,但是亚单位的数量不是很明瞭。

F1单元

ATP合酶的F1部分是亲水性的,并且负责水解ATP。 子单元创建一个具有6个结合位点的hexameter。 其中三个是催化无活性的,并且它们结合成ADP。

F1 - 子单元
子单元人类基因
alphaATP5A1, ATPAF2
betaATP5B, ATPAF1, C16orf7
gammaATP5C1
deltaATP5D
epsilonATP5E

FO单元

FO子单元F6来自ATP合酶的外周茎区。[3]

FO是具有八个子单元的和跨膜环的水不溶性蛋白质。

FO - 主要子单元
子单元人类基因
aATP6
bATP5F1
cATP5G1, ATP5G2, ATP5G3

ATP合酶的反应

ATP合成酶利用利用離子濃度梯度以合成ATP

F1 单元催化以下ATP合成反应。

ATP ADP+Pi(磷酸

F1单元催化的反映是可逆的,在进行离子运输时,进行ATP水解反应。

Fo单元形成离子通道,质子可以从中通过:

H+in  H+out

当质子利用电化学势能通过Fo单元时,可以带动和其连接的轴(γ亚单位),改变F1单元的结构,进而调节F1单元与ATP和ADP:Pi的结合能(Binding Energy),降低ATP生成的活化能,达到ATP合成的目的:

ADP + Pi + 3 H+out → ATP + 3 H+in
ATP合成的机制:ATP为红色,ADP和磷酸为粉色,旋转的γ亚基为黑色

结合模型

在ATP酶的酶学模型中,验证其γ轴是否旋转占有重要地位,1997年,英国自然杂志(vol. 386, pp. 299–302)刊了日本科学家题为"Direct observation of the rotation of F1-ATPase"的文章,报道了ATP合成酵素F1单元可以通过水解ATP造成γ亚单位(轴)的旋转,并进行了单分子观察和录像、该論文证明了保罗·博耶的「ATP合酶的旋转理论」。同年保罗·博耶,约翰·沃克延斯·克里斯蒂安·斯科因ATP合酶的研究获得诺贝尔化学奖

參見

參考資料

  1. Okuno D, Iino R, Noji H. . Journal of Biochemistry. April 2011, 149 (6): 655–64. PMID 21524994. doi:10.1093/jb/mvr049.
  2. Junge W, Nelson N. . Annual Review of Biochemistry. June 2015, 84: 631–57. PMID 25839341. doi:10.1146/annurev-biochem-060614-034124.
  3. PDB 1VZS; Carbajo RJ, Silvester JA, Runswick MJ, Walker JE, Neuhaus D. . Journal of Molecular Biology. 2004, 342 (2): 593–603. PMID 15327958. doi:10.1016/j.jmb.2004.07.013.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.