员村站

本站共有两層。地下一層為站廳，并与21号线上层站厅连通；地下二層為5號線月台及设备区。

地下一层	5号线站廳	售票機、客服中心、警务室、安检设施 前往 21号线 上层站厅
地下二层	2 站台	5号线 滘口方向（下站：潭村）
	岛式站台
	1 站台	5号线 黄埔新港方向（下站：科韵路）
	设备区	车站设备

本站共有四層。地下一層為上层站厅，并与5号线站厅连通；地下二層為下层站厅；地下三层为设备层，地下四层为21号线站台。

地下一层	21号线 上层站廳	售票機、客服中心、商店、安检设施 前往 5号线 站厅
	A口平台层	安检设施 来往A出入口及下层站厅
地下二层	21号线 下层站廳	售票機、客服中心
地下三层	设备区	车站设备
地下四层	4 站台	21号线 终点站台
	岛式站台（卫生间、母婴室）
	3 站台	21号线 增城广场方向（下站：天河公园）

5号线站厅

21号线上层站厅

21号线下层站厅

员村站共设有5号线站厅以及21号线的两层站厅。其中5号线站厅设于地下一层，21號線站廳分别設於地下一层（上层）和二層（下层）。

为了方便乘客两线换乘及行人进出，5号线站厅中间南侧及21号线两层站厅的北侧均划分为收费区，两线站厅的收费区在地下一层连通，方便乘客进行两线换乘。其中21号线两层站厅非付费区通过F出入口通道旁的楼梯和扶手电梯连接。

5号线站厅设有3条扶手电梯，1组楼梯以及1台专用电梯专用电梯供乘客来往于5号线站台。而21号线在上层站厅北侧设有3条扶手电梯以直达地下四层的21号线站台，南侧则设有3条扶手电梯以及1条楼梯前往下层的站厅；下层站厅则设有多條扶手电梯以及1台专用电梯和楼梯供乘客前往21号线站台。

因车站设计限制，21号线车站无法设置连通两层站厅至站台的专用电梯，因此轮椅人士如需乘坐专用电梯换乘5号线，则需要向车站工作人员求助，以便转乘付费区外连通E出入口的升降机前往21号线上层站厅以换乘5号线。

目前员村站设有便利店，以及自动售卖机和“好易”缴款机等自助服务设施。

3号站台

本站5号线和21号线各自设有一个島式月台，其中5号线在上層，21号线在下層。5号线站台位於規劃的花城大道東延線的地下，21号线则位于员村二横路西侧地底。

本站的卫生间以及母婴室设于21号线站台南端。

因天河公園至員村一段在未來要移交11號線，因此本站21号线部分直接建成一个能够容纳8节编组A型车（11号线使用车型）停靠的站台。由于21号线自身使用6节编组B型车，因此站台屏蔽门现时按照6B编组列车安装，多出来的长度则直接以玻璃板假墙暂时封闭。同時，21號線站台、折返線以及本站至天河公園站一段亦已預先安裝11號線所需的接觸網。

另外，21号线在站台南端設有一條存車線。目前21號線所有列車皆使用該組存車線折返。在早晚高峰過後及晚上收車前夕，部分列車在4號月台清客後會退出服務，然後折返至3號月台開出，沿途不停站返回水西停車場或鎮龍車輛段。屆時3號月台會發出廣播提醒乘客不能上車。正線南端盡頭則預留了延伸的條件，供11號線續建時接入。

1号站台全景图

4号站台全景图

员村站目前共设有6个出入口供乘客进出。初期车站启用时设有3个出入口，其中D出入口于2018年启用。21号线开通后，新增3个出入口，并开放重置后的A出入口，后续B出入口亦新增设通往21号线上层站厅的联络通道。

編號	设施	照片	出口指示	建議前往的目的地
5号线站廳
B			員村二橫路	程界西（地铁员村站）公交车站（北行）
C			員村二橫路	员村三横路、員村新街、员村工人文化宫、中山大学附属第六医院
D			員村二橫路	程界西（地铁员村站）公交车站（南行）
21号线站廳
A			員村二橫路	临江大道
E			員村二橫路
F			員村二橫路
註︰ 設有 |  設有 |  設有 |  設有輪椅升降台 |  設有扶手電梯

员村站最早於1997年的《廣州市城市快速軌道交通線網規劃研究（最終報告）》中出现，當時的3號綫设有本站，位置与现时基本一致。然後於2003年方案中，原3號綫易名为5号线，仍设置本站，并基本落实兴建[4]。後來在2008年方案中，當時的環線（8號線）亦經過本站，成為與5號線的其中一個換乘站[5]。其後在2010年規劃中，環線改為完全新建，編號亦調整為11號線。車站成為5號線與11號線的其中一個換乘站[6]。

在21號線進一步設計時，考慮到21號線通車時，終點站天河公園站的11號線和13號線仍未建成開通，令21號線抵達終點時成為「斷頭路」。故此讓21號線暫時借用11號線的天河公園站至本站的一段，令21號線可以與5號線交匯，更好地接入線網。待11號線全線建成前夕，再把該段拆離21號線，歸還給11號線運營[7]。

5號線员村站在2006年正式动工；2009年6月28日，本站三权正式移交营运事业总部；2009年12月28日，5号线正式开通运营，本站正式启用。

2013年12月20日，二十一号线员村站开工，是二十一号线首个开工的车站[8]。因应21号线车站建设，5号线站厅原有的付费区由原来的北侧改为南侧，同时拆卸5号线站厅的商店，以及重置警务室。2018年7月，21号线车站主体结构封顶[9]。2018年12月6日，为配合21号线施工，原位于D口附近的A口封闭[10]。

2019年12月20日，本站21号线车站部分随21号线后通段开通而启用；早前关闭的A口已被重置于员村二横路东侧靠近石东小学旁，并于同日开通[11]。

2022年年末疫情期间，本站曾受防控措施影响，于11月26日至11月30日下午暂停进出站，仅保留站内换乘服务[12][13]。

11號線開通前夕，天河公園至員村段將會拆離21號線，回歸成為11號線的一部分進行運營[7]。但因11号线预定使用8节编组A型车，届时将要拆卸本站原21号线站台的6B编组屏蔽门和玻璃板假墙，然后安装8A编组适用的屏蔽门；同时需要拆卸车站月台以及本站至天河公园站区间的第三轨，以及更换至11号线的信号系统等。预计届时需要停运天河公園至員村段以及本站3、4号站台，以配合工程。

另外，未来車站移交给11号线之后，现时的21号线存车线亦会用于存放11号线备用列车，或用於11號線小交路列車折返。

未來11号线樓層

地下一层	11号线 上层站廳	售票機、客服中心、商店、安检设施 前往 5号线 站厅
	A口平台层	安检设施 来往A出入口及下层站厅
地下二层	11号线 下层站廳	售票機、客服中心
地下三层	设备区	车站设备
地下四层	4 站台	11号线 内环方向（下站：琶洲）
	岛式站台（公共洗手间、母婴室）
	3 站台	11号线 外环方向（下站：天河公园）