小三通

1994年1月由中國大陸单方面實施《關於對台灣地區小額貿易的管理辦法》，指定福建、浙江、江蘇、上海、山東等東南沿海口岸，由台灣居民和中國大陸對台小額貿易公司進行「小額貿易」。

小三通口岸：金門水頭碼頭

1993年12月2日與1994年3月2日陳清寶立委與陳癸淼立委先後提出「離島建設條例」草案。

1994年6月由金馬愛鄉聯盟提出《金馬與大陸小三通說帖》，表達希望能以「單向通航」、「定點直航」或「先海後空」、「現貨後客」等方式，漸漸進行小三通。

1997年4月19日，兩岸開始進行高雄與福州、廈門間的「不通關、不入境」的境外通航。

2000年3月21日，中華民國立法院通過《離島建設條例》第18條，訂明「為促進離島（指澎金馬地區）發展，在台灣本島與大陸地區全面通航之前，得先行試辦金門、馬祖、澎湖地區與大陸地區通航」（俗稱小三通條款），條例於同年4月5日實施。12月13日，中華民國行政院根據《離島建設條例》通過《試辦金門馬祖澎湖與大陸地區通航實施辦法》，以作為小三通的管理依據。預定於2001年1月1日開始實施定點定時的客運船班[1]。

2001年1月2日，從金門開出第一班往廈門的客輪，小三通正式啟動。[2]

目前有「金門水頭—廈門五通」、「金門水頭—泉州石井」、「南竿福澳—福州琅岐」、「北竿白沙—福州黃歧」的小三通固定船班。

2008年，行政院曾研議放寬小三通的限制，將其放寬為「中三通」；但並未施行。2008年2月20日，行政院大陸委員會主任委員陳明通表示，行政院將盡可能放寬小三通適用對象，但無法全面開放、不限身分開放。[3]

2008年6月19日，擴大小三通方案19日正式公告實施，只要持有兩岸入出境有效證件，就可以從金門或馬祖進出中國大陸。陸委會主委賴幸媛說，擴大小三通是政府照顧金馬地區民眾的一項政策，緩和未來兩岸直航所帶來的影響。 擴大小三通方案下午正式公告後，在金門碼頭，一艘載著200多名乘客的客輪隨即從金門出發，駛往對岸，成為擴大小三通實施後的第一個航班。

在擴大案實施後，金馬逐漸發展成為來往兩岸的一個轉運站。但大量非本地旅客利用金馬往來台灣的航線，造成當地居民購票的困難。另外，由於離島居民購買機票有補助，也吸引台灣居民遷戶口至金馬地區，導致金門實住人口僅約戶籍人口的一半。

在2003年5月17日至7月18日，由于SARS事件的爆发，小三通一度暂停[4][5]。

中国大陸自2011年起允許福建九個城市居民，不必辦理入台證，只要辦理入金證就可赴金門、馬祖、澎湖自由行，且入金證不需財力證明，也可提前申請或落地簽。後又陸續開放多個城市適用，目前共有20個城市適用。2019年繼大陸停發個人簽證與限縮團客配額後，傳小三通將停航，陸客將不可透過小三通來台[6]，但其後两岸官员否定此說法[7]。

2019冠状病毒病疫情发生后，小三通客船服务减到每天10班，日客流量下滑至400多人[5]。2020年2月7日，陸委會宣布，經中央流行疫情指揮中心討論後，自2月10日起暫停小三通客船服务，为自2003年SARS疫情以来再次暂停[4]。5月15日，中华民国交通部召開第七次防疫會議，研商第三階段的交通觀光防疫措施鬆綁推動方案（草案），其中有關兩岸客運航點、海運直航及小三通客船航班等，交通部規劃於10月1日全面恢復[8]，但恢复方案受疫情发展延期。2021年3月17日，中华民国卫生福利部长陈时中强调，要等到台湾民众施打疫苗达到六成覆盖率再考虑恢复小三通[9]。

3月底，廈門台商協會會長吳家瑩表示，向廈門市人民政府私下了解，對方透露，一旦金廈小三通恢復，只要持台灣或中国大陸方面發出的核酸檢測陰性證明，可以七天內往返金廈，不必進行隔離[10]。4月29日，福建省人民政府新闻办公室在官方微博发布公告，福建省将于5月10日开设“便捷通道”，放宽台湾人（中華民國國民）从台湾直航和金马地区进入福建的检疫规定，台湾人士可比照中国大陆低风险地区入（返）闽人员进行管理，无需隔离，片面恢复小三通。在中国大陆面对境外输入新冠病毒压力、台湾爆发华航诺富特酒店群聚感染事件的背景下，中国大陆网络舆论对福建省人民政府进行强烈抨击。30日，中共官媒《环球时报》总编辑胡锡进发文，表示理解网友担心与不满的合理性，指出此举是福建省人民政府的主张，非中央人民政府“分配给福建的‘任务’”。亦有作者指出，对台工作“不只要面对台湾的反应，更需要同时顾及大陆民众的利益与感受，避免‘仇台’的结打得越来越紧。”5月8日，福建省应对新冠肺炎疫情工作领导小组（指挥部）综合协调组发布公告，推迟实施台胞（中華民國國民）来闽检疫“便捷通道”试点工作。福建有关方面负责人（具体身份不详）辩解，便捷通道“是符合科学严谨防疫要求的，并不是无条件免隔离。”[11]

2022年10月14日，金門縣區域立委陳玉珍在立法院質詢陸委會何時恢復小三通，陸委會主委邱太三表示由於大陸方面原有的檢疫、海關組織並未有所準備，小三通恢復要視陸方情形而定，行政院長蘇貞昌也提到：「小三通兩邊有機制，台灣的現在都還完整，但中國把自己的機制都撤掉了，怎麼通；兩邊要通，但它們那邊關起來，沒有機制，怎麼通。」[12]

2022年12月22日，行政院宣布試辦恢復小三通，第一階段實施期間自2023年1月7日至2月6日為止（春節前後2周），考量疫情風險[13]，航班申請採專案申請方式，金門每天至多一班，馬祖每週至多兩班。[14]对象只限金马地区民众和金马地区的大陆配偶，不包含台商中转。[15]

2023年2月10日上午、從泉州南安首發前往金門的小三通航線重新啟用，但仍未開放金馬及大陸配偶以外的居民通行。[16]截至2月19日，4条“小三通”客运航线全部复航。[17]

2023年3月16日陸委會宣布、3月25日起開放小三通客運中轉，國人及陸配均可搭乘往返中國大陸，不再只限金、馬居民搭乘，但大陸人士還不能中轉到台灣本島。[18]

2023年4月1日國台辦宣布，不再需要提前48小時準備PCR核酸報告，只需24小時內抗原快篩陰性即可。唯第三地旅客經由台灣中轉進入中國大陸者，則仍需持有始發地48小時內的PCR核酸陰性證明。[19]

2023年7月18日，陆委会表示自7月20日起，持有探亲入出境许可证的大陆配偶亲属可经由小三通入台探亲。[20]

2023年9月27日，內政部移民署公告外國籍與港澳地區人士可经由小三通往返兩岸。[21]

2024年4月1日起，福建泉州至金门“小三通”航线调整至每日一班往返[22]。