小卡哈爾體RNA
小卡哈爾體RNA(Small Cajal body-specific RNA,簡稱scaRNA)是動物細胞核卡哈爾體中的一類H/ACA匣(H/ACA box)snoRNA[1],卡哈爾體為細胞組裝核小核糖核蛋白(snRNP)的位置。ScaRNA可在卡哈爾體中參與U1剪接體RNA、U2剪接體RNA、U4剪接體RNA、U5剪接體RNA和U12次要剪接體RNA等剪接體RNA的甲基化(2'-O-甲基化)與假尿苷化修飾,另外果蠅的scaRNA還參與28S rRNA的修飾[2]。最早被發現的小卡哈爾體為U85 RNA,於2011年在人類細胞中發現[3]。
小卡哈爾體RNA | |
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小卡哈爾體RNA1的次級結構 | |
识别符 | |
代号 | SCARNA1 |
Rfam | RF00553 |
其他数据 | |
RNA类型 | snoRNA、scaRNA |
域 | 動物 |
多數snoRNA與scaRNA均位於內含子中,隨其他基因一起轉錄,但有少數scaRNA為RNA聚合酶II獨立轉錄[4],此類scaRNA中有數個還可被DGCR8和Drosha切割成更小的RNA碎片,這些碎片於核仁中可與其他蛋白組成RNP,可影響snoRNA對rRNA的修飾[5]。
參考文獻
- Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T. . Molecular and Cellular Biology. 2004, 24 (13): 5797–5807. PMC 480876 . PMID 15199136. doi:10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004.
- Deryusheva S, Gall JG. . RNA. 2013, 19 (12): 1802–1814. PMC 3884663 . PMID 24149844. doi:10.1261/rna.042028.113.
- Jády BE, Kiss T. . The EMBO Journal. 2001, 20 (3): 541–551. PMC 133463 . PMID 11157760. doi:10.1093/emboj/20.3.541.
- Gérard MA, Myslinski E, Chylak N, Baudrey S, Krol A, Carbon P. . Nucleic Acids Res. 2010, 38 (2): 370–81. PMC 2811027 . PMID 19906720. doi:10.1093/nar/gkp988.
- McLaurin DM, Logan MK, Lett KE, Hebert MD. . Biol Open. 2020, 9 (10). PMC 7648615 . PMID 33037012. doi:10.1242/bio.054619.
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