平木站

設有一座以鋼架及木板及鐵皮所搭成的單層簡易式站房，於1978年改裝，於1號月台旁邊延伸而建，採用缺角開放式的玄關，進站後，前端為候車大堂，設有兩張候車長櫈，後端為已停用的站務室及服務窗口，並放置了一部簡易式自動售票機及一座投幣式公共電話，而在開放式閘口中央則安裝了入站用的IC卡感應器。

側式月台2座。長度分別為60米（1號月台）及50米（2號月台），兩個月台均採用無障礙斜道設計，並以以站內平交道連接。月台上設有長10米（2號月台）及15米（1號月台）的有蓋候車亭。在2號月台出入口處放置了一部出閘專用的IC卡感應器，但1號月台上卻沒有裝置出閘專用感應器。另外在站內建有座男、女共用的洗手間，設於1號月台平交道旁。

而在2號月台外側則另外設有1條側線，供區間車在此停泊，由於部份軌道因彎度而遠離月台邊沿，因此2號月台外側不能作上落乘客用途，並且全用欄杆圍封。而該側線線道為單向式，只能由學園通方向的轉轍器駛進，末端並沒有連接至向農學部前方向，列車進出側線都必須由正軌上的轉轍器內進行。