日本駐中華民國大使館

1873年11月24日，日本在大清北京設置「日本帝國駐清國公使館」（）[5][註 1]。

日本驻南京大使馆旧址

中華民國成立後公使館成為「日本帝國駐中華民國公使館」（），中華民國定都南京市後遷往南京市。公使館時期，有多次提案建議將其升格為大使館以改善華日關係。1935年5月17日，公使館在日本外務大臣廣田弘毅主持下升格為「日本帝國駐中華民國大使館」（）[7]。同時廣田建議英国、法國、美国、德國也將駐華公使館升格為大使館，得到各國同意。然而日本軍部強烈反對對華和解，並強化華北分離工作。廣田受此影響，提出廣田三原則，硬化對華態度，令中華民國行政院院長汪精卫等國民政府親日派受挫[8]。

1937年七七事变後，大使館撤銷。同年12月日本军攻下南京市後，日本將「日本帝國駐南京總領事館」（）遷至大使館舊址[9]。

1940年3月30日，親日派汪精衛在南京市另建國民政府，與自南京市遷至陪都重慶市抗日的蔣中正國民政府分離[10]。之後日本在原址復設大使館，並將總領事館遷出[9]。大使館一直營運至1945年8月15日日本向同盟國投降，結束對華戰爭[11]。戰後館舍被國民政府沒收，用作外交部宿舍[9]。

終戰後，日本進入盟軍佔領時期，日本駐外使領館悉數裁撤，惟1950年2月始獲美國許可而設立日本政府在外事務所作為日僑僑務、商務處理機構[1]^:274。同年4月19日，《日本政府在外事務所設置法》（昭和25年法律第105號）公布並同時施行，成為日本復設駐外機構的法源[12]。日方並於該年9月向遷至臺灣的中華民國政府提出在臺灣派駐代表之要求，中華民國行政院遂於1951年1月17日透過院會決議核准日本代表駐臺，兩國並於同年10月1日同時公布日本政府在外事務所在臺設置之消息[1]^:274。

1951年11月17日，「駐臺北日本政府在外事務所」（）於臺北市中山北路二段109號正式開館，正副所長分別為木村四郎七和中田豐千代。該事務所具有核發日本護照等政府機能[1]^:274-275。1952年2月1日，日本駐臺事務所經臺方同意後，得以擴大館務、並獲得與中華民國政府直接行文、使用外交密電碼及外交郵袋等權限[1]^:274-275。

1952年4月28日，日本與中華民國簽訂《中華民國與日本國間和平條約》[13]，條約並於同年8月5日批准換文生效[1]^:276。同年12月26日，日方在臺北設置「日本國駐中華民國大使館」[14]，日本政府駐臺北在外事務所隨之裁撤，中山北路二段109號的事務所舊址轉為大使館第一代館址使用。大使開館後的第一代日本大使為芳澤謙吉，原在外事務所所長木村四郎七亦轉調至大使館服務，與清水董三同時擔任使館參事[1]^:276。

1956年，日本大使館遷至中山北路三段25號的第二代館址[1]^:276。1963年4月1日，與「日本國駐臺北總領事館」（）合署辦公[15]。至1972年大使館閉館之前，末代館址為城中區濟南路二段34號[3][4]。

1972年9月29日，日本與中華人民共和國建交，並與中華民國斷交，之後雙方互設的大使館與總領事館都遭廢止[16]。斷交後，日本在臺灣設置了實質大使館「交流協會」（現日本台灣交流協會）[17]。