清华大学医学院

生物医学工程系，在1979年创办的电机系生物医学工程专业基础上成立。本科学制4年，以电子技术系列课程为主干。

2001年至2008年，临床医学系与北京协和医学院紧密合作，开设临床医学专业，学制8年，医预阶段（2.5年）在清华本部，基础医学和临床医学在协和医学院，完成学业后获得医学博士学位。

2009年，開設医学实验班，學制8年，採用“3+2+3”的培养方案，3年清華基礎課程，2年匹茲堡大學科研訓練，3年协和医院臨床實習，完成学业获得医学博士学位，办学目标為培养医师科学家。

临床医学系同时拥有外科学、内科学硕士研究生。

基础医学系于2012年11月10日上午正式成立，按照转化医学的发展，研究膜蛋白与重大疾病、表观遗传与癌症、干细胞与再生医学、神经科学与疾病、免疫与传染病等领域。

药学系于2012年11月10日上午正式成立，定位于应用基础研究，研究药物化学、肿瘤药理学、离子通道与痛觉药理学、药物制剂及药物递送、药物代谢与毒理等领域。2015年12月25日，成立清華大學藥學院[6]。

北京华信医院（清华大学第一附属医院），院长吴清玉。

• 1959年2月，创办国家信息产业部直属医院，先后称为电子总医院、401医院、北京酒仙桥医院。
• 2003年，划归清华大学。
• 2003年，聘请美国Paul L. Huang医生为生物科技和新药开发首席科学家。
• 2004年，更名为北京华信医院（清华大学第一附属医院）。

清华大学玉泉医院（清华大学第二附属医院），院长左焕琮。

• 1983年12月，创办国家信息产业部直属医院，称为402医院。
• 2003年，划归清华大学。
• 2004年，更名为清华大学玉泉医院（清华大学第二附属医院）。

北京清华长庚医院位于天通苑，由台湾长庚纪念医院及台塑集團支持建设合作。

• 2010年4月20日，北京清华长庚医院一期工程奠基。
• 2014年11月28日，正式開業。