第3次超級機器人大戰α 終焉之銀河

★標誌為系列作初參戰作品、☆標誌為在家用機中的初參戰作品。α標誌為從α系列回歸的作品

• α超獸機神斷空我（）
• 戰國魔神豪將軍（）
• α新世紀福音戰士（）
• α新世紀福音戰士 劇場版（）
• 传说巨神伊迪安（）
• 勇者王GaoGaiGar（）
• ★勇者王GaoGaiGar FINAL（）
• ★電腦戰機VIRTUAL-ON ORATORIO TANGRAM（）
• ★電腦戰機VIRTUAL-ON MARZ（）
• 機動戰士GUNDAM0083 STARDUST MEMORY（）
• 機動戰士Z GUNDAM（）
• 機動戰士GUNDAM ZZ（）
• 機動戰士GUNDAM 馬沙之反擊（）
• 新機動戰記GUNDAM W 無盡的華爾茲（）
• ★機動戰士GUNDAM SEED（）
• 無敵鋼人泰坦3（）
• 鐵甲萬能俠（）
• 鐵甲萬能俠2號（）
• 三一萬能俠（）
• 三一萬能俠G（）
• 真·三一萬能俠（原作漫画版）（）
• 鋼鐵吉克（）
• 超力電磁俠（）
• V型電磁俠（）
• 鬥將大武士（）
• 大空魔龍（）
• α勇者雷登（）
• α飛越巔峰（）
• α超時空要塞 愛、還記得嗎？（）
• αMacross Plus（）
• ☆α超時空要塞7（）
• 萬普原創（）

全31作品，是α系列參戰作品最多，初參戰作品為《勇者王GaoGaiGar Final》、《電腦戰機VIRTUAL-ON ORATORIO TANGRAM》、《電腦戰機VIRTUAL-ON MARZ》、《機動戰士鋼彈SEED》4部作品。 《超時空要塞7》為家用機初參戰。雖然沒有明記參戰作品、遊戲《新世紀福音戰士2》的EVA初號機F型裝備也在遊戲中登場。

《機動戰士鋼彈SEED》是《第2次α》發售後進行的問卷調查「下次想要參戰的作品」為人氣最高的作品、才得以實現在本作品的參戰[5]。因《機動戰士鋼彈SEED》參戰的影響、本作的首周銷售量是過去系列以來的最高記錄[6]。

《勇者王GaoGaiGar Final》本來是沒有預定參戰，由於作品的範疇與本作十分搭調，在經過嘗試後開發人員最後決定加入本作的參戰陣容[5]。

《電腦戰機VIRTUAL-ON ORATORIO TANGRAM》、《電腦戰機VIRTUAL-ON MARZ》以遊戲作品的名義登場。作為今後讓遊戲作品也能夠參戰的可能性，遊戲製作人亙重郎做出了肯定的回應而得以參戰[1]。這兩作品在故事當中有著特別待遇。的聲優由SEGA社員光吉猛修所擔任。

《傳說巨神伊甸王》、《飛越巔峰》兩作品在α系列的最終作登場，在「α」系列的開發當初是決定好的事情[7]。 還有，把遊戲一次全破之後，可以重現《傳說巨神伊甸王》本篇最後結局的特殊結局。

《超時空要塞7》在《第2次α》的製作時期時已決定參戰[1]。同作品在設定上距離《超时空要塞》已經有30年以上的時間。麥克斯米利安·吉納斯（）與米莉亞·芬莉娜·吉納斯（）等，跨越兩作品的登場角色，吉納斯夫妻的女兒米蓮·吉納斯（）登場。本作在與傑特拉帝人戰鬥過後（《α》）沒有經過多少時間，Macross7船團為何經過30年以上的時間有著特別的理由。

《第2次α》的關係人物登場的《超機大戰SRX》的主要角色再度登場，跟前作《第2次α》的參戰名義同樣是《萬普原創》。

• 鐵甲萬能俠（鐵甲萬能俠）
• EVA初號機（新世紀福音戰士）
• VF-1S・S女武神B（超時空要塞 愛、還記得嗎？）
• 鐵木真747J（電腦戰機VIRTUAL-ON MARZ）
• （勇者雷登）
• （傳說巨神伊迪安）
• 自由GUNDAM（機動戰士高達 SEED）
• 凱王（大空魔龍）
• Star GaoGaiGar（勇者王GaoGaiGar）
• 斷空我（超獸機神斷空我）
• GunBuster（飛越巔峰）
• （V型電磁俠）