組蛋白密碼

組蛋白密碼（Histone code）是一個描述真核生物藉修飾包裹DNA的組蛋白（主要是其N端尾）以調控基因表現的理論，和DNA甲基化共同組成表觀遺傳密碼[2] 。組蛋白上的修飾包括乙醯化、甲基化、磷酸化、泛素化、二磷酸腺苷核糖基化、GlcNAc糖基化[3]、瓜氨酸化、脯胺酸異構化[4]與SUMO修飾等[5]，這些修飾的組合可影響染色體結構以及與其他蛋白的結合力，提升或降低基因的轉錄。人類細胞中組蛋白修飾的種類複雜，其中某幾種修飾可能傾向出現在同一個組蛋白上[6]。近年由於質譜法技術的發展而有更多修飾種類與位點被發現[7]，也有許多研究探討加上或移除組蛋白修飾的多種酵素，以及可辨認這些修飾而與之結合的其他蛋白[8]。

已知的組蛋白修飾位點與種類[1]

種類
組蛋白修飾對基因轉錄的影響
修飾種類 組蛋白位點
H3K4 H3K9 H3K14 H3K27 H3K79 H3K36 H4K20 H2BK5 H2BK20
單甲基化 促進[9] 促進[10] 促進[10] 促進[10][11] 促進[10] 促進[10]
雙甲基化 抑制[12] 抑制[12] 促進[11]
三甲基化 促進[13] 抑制[10] 抑制[10] 促進[11]
抑制[10]		 促進 抑制[12]
乙醯化 促進[14] 促進[13] 促進[13] 促進[15] 促進

參考文獻
  1. Rodríguez-Paredes M, Esteller M. . Nat Med. 2011, 17 (3): 330–9. PMID 21386836. doi:10.1038/nm.2305.
  2. Jenuwein T, Allis C. . Science. 2001, 293 (5532): 1074–80. PMID 11498575. doi:10.1126/science.1063127.
  3. K, Sakabe; Z, Wang; Gw, Hart. . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2010-11-16, 107 (46): 19915–20. Bibcode:2010PNAS..10719915S. PMC 2993388 可免费查阅. PMID 21045127. doi:10.1073/pnas.1009023107.
  4. Nelson CJ, Santos-Rosa H, Kouzarides T. . Cell. September 2006, 126 (5): 905–16. PMID 16959570. doi:10.1016/j.cell.2006.07.026.
  5. Nathan D, Ingvarsdottir K, Sterner DE, et al. . Genes Dev. April 2006, 20 (8): 966–76. PMC 1472304 可免费查阅. PMID 16598039. doi:10.1101/gad.1404206.
  6. Wang Z, Zang C, Rosenfeld JA, Schones DE, Barski A, Cuddapah S, et al. . Nat Genet. 2008, 40 (7): 897–903. PMC 2769248 可免费查阅. PMID 18552846. doi:10.1038/ng.154.
  7. Tan M, Luo H, Lee S, Jin F, Yang JS, Montellier E, et al. . Cell. 2011, 146 (6): 1016–28. PMC 3176443 可免费查阅. PMID 21925322. doi:10.1016/j.cell.2011.08.008.
  8. Wang M, Mok MW, Harper H, Lee WH, Min J, Knapp S, Oppermann U, Marsden B, Schapira M. . Bioinformatics. 24 Aug 2010, 26 (20): 2629–2630. PMC 2951094 可免费查阅. PMID 20739309. doi:10.1093/bioinformatics/btq491.
  9. Benevolenskaya EV. . Biochemistry and Cell Biology = Biochimie Et Biologie Cellulaire. August 2007, 85 (4): 435–43. PMID 17713579. doi:10.1139/o07-057.
  10. Barski A, Cuddapah S, Cui K, Roh TY, Schones DE, Wang Z, et al. . Cell. May 2007, 129 (4): 823–37. PMID 17512414. doi:10.1016/j.cell.2007.05.009.
  11. Steger DJ, Lefterova MI, Ying L, Stonestrom AJ, Schupp M, Zhuo D, et al. . Molecular and Cellular Biology. April 2008, 28 (8): 2825–39. PMC 2293113 可免费查阅. PMID 18285465. doi:10.1128/MCB.02076-07.
  12. Rosenfeld JA, Wang Z, Schones DE, Zhao K, DeSalle R, Zhang MQ. . BMC Genomics. March 2009, 10: 143. PMC 2667539 可免费查阅. PMID 19335899. doi:10.1186/1471-2164-10-143.
  13. Koch CM, Andrews RM, Flicek P, Dillon SC, Karaöz U, Clelland GK, et al. . Genome Research. June 2007, 17 (6): 691–707. PMC 1891331 可免费查阅. PMID 17567990. doi:10.1101/gr.5704207.
  14. Guillemette B, Drogaris P, Lin HH, Armstrong H, Hiragami-Hamada K, Imhof A, et al. . PLoS Genetics. March 2011, 7 (3): e1001354. PMC 3069113 可免费查阅. PMID 21483810. doi:10.1371/journal.pgen.1001354.
  15. Creyghton MP, Cheng AW, Welstead GG, Kooistra T, Carey BW, Steine EJ, et al. . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. December 2010, 107 (50): 21931–6. PMC 3003124 可免费查阅. PMID 21106759. doi:10.1073/pnas.1016071107.
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