原鲸科

慈母鯨骨架描繪圖

羅德侯鯨復原圖

原鯨科物種具有於陸地上支撐身體的四肢，為水陸兩棲的動物，但目前並不知道牠們是否具有與現代鯨豚一樣的尾葉，不過已知的是，牠們較其他早期的鯨魚更適應水生的生活形式。以羅德侯鯨為例，陸生哺乳動物具有骶骨，是由5塊椎骨合併而成，是骨盆帶的基部，但羅德侯鯨的骶骨則已是分節的椎骨，但仍保有薦髂關節；牠們的鼻孔不再位於口鼻部的尖端，而是逐漸朝頭頂位置後退；且牠們的趾上仍然保有和偶蹄目一樣的蹄。此外，隨著懷孕慈母鯨化石的發現，更證實了原鯨科物種具有生存於陸上的能力[1]，該樣本中保有化石化的胎兒，以頭部朝外的形式保留，這顯示了慈母鯨仍然是於陸地上進行生產。

神盾鯨屬骨架描繪圖

喬治亞鯨復原圖

原鯨科下的亞科演化支由Gingerich et al. 2005所提出，他們將瑪卡拉鯨屬至於獨立的瑪卡拉鯨亞科下，肇因於牠們獨特的特徵－前頜骨僅有兩顆門齒。其他物種則根據牠們對於水生的適應程度分為兩個亞科[2]；

原鯨亞科－為生存於盧台特期的原鯨科物種，牠們的前頜骨具有三對門牙、頜骨具有三對臼齒，由目前已知的特徵（多半來自羅德侯鯨與旅鯨）得知[3]，牠們具有與陸生哺乳動物類似的骨盆，與髂骨和無名骨絞接的骶骨，及適合於水中推進的強壯後肢[2]。本亞科主要包含：

喬治亞鯨亞科－為生存於巴爾頓期的原鯨科物種，被認為是演化成龍王鯨科的過渡物種。牠們的顱骨與齒式與原鯨亞科類似，但是椎骨與無名骨之間並無絞接，且薦髂關節已退化。喬治亞鯨亞科骨盆的形式顯示牠們主要仰賴尾巴而非後肢推進，2019年所發現的神盾鯨屬更是證實了這一觀點[2][4]。本亞科主要包含：