碳酸酐酶

碳酸酐酶英語:,EC 4.2.1.1)又稱碳酸脫水酶英語:),為催化二氧化碳/水與碳酸間轉換的酵素[1],可維繫血液中的酸鹼平衡與二氧化碳的運輸[2]。此類酵素的活性位點通常有一個鋅離子,因而屬於金屬蛋白,在被研究最多的α型碳酸酐酶中,鋅離子與三個組氨酸咪唑螯合[3]

碳酸酐酶
人類碳酸酐酶II的結構,中央為一鋅離子
识别码
EC編號 4.2.1.1
CAS号 9001-03-0
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PRIAM 概述
PDB RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
基因本体 AmiGO / EGO
碳酸酐酶(真核生物)
鑑定
標誌Carb_anhydrase
PfamPF00194旧版
InterProIPR001148
PROSITEPDOC00146
SCOP1can / SUPFAM
膜蛋白數據庫333

碳酸酐酶可催化以下反應:

CO2 + H2O H
2
CO
3
H+ + HCO
3
H+ + HCO
3
H
2
CO
3
CO2 + H2O
碳酸酐酶催化的反應機理

種類

碳酸酐酶有α、β、γ、δ與ζ等五大類,不同類別碳酸酐酶的氨基酸序列無顯著相似,應是趨同演化的結果。人類的碳酸酐酶屬α型。

近年又有η型與ι型的碳酸酐酶被發現。

α型

脊椎動物、部分藻類與細菌具有α型的碳酸酐酶。

哺乳類的碳酸酐酶比較
碳酸酐酶 基因 分子量[4]
(kDa)
分布位置 人類酵素的效率[lower-alpha 1][5] (s−1) 磺酰胺的抑制係數(KI (nM))[5]
細胞 組織[4]
碳酸酐酶ICA129細胞質红血球消化道2.0 × 105250
碳酸酐酶IICA229細胞質廣泛分布1.4 × 10612
碳酸酐酶IIICA329細胞質一型骨骼肌(8%可溶性蛋白均為碳酸酐酶III)1.3 × 104240000
碳酸酐酶IVCA435胞外(與糖磷脂酰肌醇相連)消化道、1.1 × 10674
碳酸酐酶VACA5A34.7(估計)線粒體肝臟2.9 × 10563
碳酸酐酶VBCA5B36.4(估計)線粒體廣泛分布9.5 × 10554
碳酸酐酶VICA639–42分泌至胞外唾液母乳3.4 × 10511
碳酸酐酶VIICA729細胞質廣泛分布9.5 × 1052.5
碳酸酐酶IXCA954, 58细胞膜消化道(數種腫瘤組織亦有分布)3.8 × 10516
碳酸酐酶XIICA1244活性位点位於胞外腎(數種腫瘤組織亦有分布)4.2 × 1055.7
碳酸酐酶XIII[6]CA1329細胞質廣泛分布1.5 × 10516
碳酸酐酶XIVCA1454活性位点位於胞外腎、心臟、骨骼肌、3.1 × 10541
CA-XV[7]CA1534–36胞外(與糖磷脂酰肌醇相連)腎(不存在於人類組織)4.7 × 10572

β型

原核生物與植物葉綠體具有β型碳酸酐酶。

γ型

甲烷菌具有γ型碳酸酐酶。

δ型

矽藻具有δ型碳酸酐酶[8]

ɛ型

ɛ型碳酸酐酶見於部分化學自營細菌與藍菌羧酶体[9],其結構與β型有相似之處,可能為同源,但氨基酸序列已徹底分化[8]

ζ型

ζ型碳酸酐酶僅見於矽藻等部分藻類[10]威氏海链藻(一種矽藻)的ζ型碳酸酐酶可使用(而非鋅)為輔酶[11]

η型

η型碳酸酐酶見於瘧原蟲,過去被認為屬於α型,後來發現其金屬離子螯合模式等特徵與其不同[12]

ι型

ι型碳酸酐酶為截至現在最晚發現的碳酸酐酶,自假微型海链藻(一種矽藻)中發現,也存在其他海生浮游藻類。相較於其他碳酸酐酶使用鋅離子催化,ι型碳酸酐酶使用錳離子催化[13]。一些細菌可能也具此類碳酸酐酶[14]

參見

  • 碳酸酐酶抑制物
  • 玻爾效應
  • 碳捕集與封存

註腳

  1. CA XV除外(為小鼠酵素)

參考文獻

  1. Badger MR, Price GD. . Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1994, 45: 369–392. doi:10.1146/annurev.pp.45.060194.002101.
  2. . RCSB: PDB-101. [3 December 2018]. (原始内容存档于2022-11-13).
  3. Krishnamurthy VM, Kaufman GK, Urbach AR, Gitlin I, Gudiksen KL, Weibel DB, Whitesides GM. . Chemical Reviews. March 2008, 108 (3): 946–1051. PMC 2740730可免费查阅. PMID 18335973. doi:10.1021/cr050262p.
  4. Unless else specified: Boron WF. . Elsevier/Saunders. 2005. ISBN 978-1-4160-2328-9. Page 638
  5. Hilvo M, Baranauskiene L, Salzano AM, Scaloni A, Matulis D, Innocenti A, et al. . The Journal of Biological Chemistry. October 2008, 283 (41): 27799–809. PMID 18703501. doi:10.1074/jbc.M800938200可免费查阅.
  6. Lehtonen J, Shen B, Vihinen M, Casini A, Scozzafava A, Supuran CT, et al. . The Journal of Biological Chemistry. January 2004, 279 (4): 2719–27. PMID 14600151. doi:10.1074/jbc.M308984200可免费查阅.
  7. Hilvo M, Tolvanen M, Clark A, Shen B, Shah GN, Waheed A, et al. . The Biochemical Journal. November 2005, 392 (Pt 1): 83–92. PMC 1317667可免费查阅. PMID 16083424. doi:10.1042/BJ20051102.
  8. Sawaya MR, Cannon GC, Heinhorst S, Tanaka S, Williams EB, Yeates TO, Kerfeld CA. . The Journal of Biological Chemistry. March 2006, 281 (11): 7546–55. PMID 16407248. doi:10.1074/jbc.M510464200可免费查阅.
  9. So AK, Espie GS, Williams EB, Shively JM, Heinhorst S, Cannon GC. . Journal of Bacteriology. February 2004, 186 (3): 623–30. PMC 321498可免费查阅. PMID 14729686. doi:10.1128/JB.186.3.623-630.2004.
  10. Alterio V, Langella E, Buonanno M, Esposito D, Nocentini A, Berrino E; et al. . Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19: 3427–3436. PMC 8217695可免费查阅. PMID 34194668. doi:10.1016/j.csbj.2021.05.057.
  11. Park H, McGinn PJ, More FM. . Aquatic Microbial Ecology. 19 May 2008, 51: 183–193. doi:10.3354/ame01192可免费查阅.
  12. Del Prete S, Vullo D, Fisher GM, Andrews KT, Poulsen SA, Capasso C, Supuran CT. . Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. September 2014, 24 (18): 4389–4396. PMID 25168745. doi:10.1016/j.bmcl.2014.08.015. hdl:10072/63103可免费查阅.
  13. Jensen EL, Clement R, Kosta A, Maberly SC, Gontero B. . The ISME Journal. August 2019, 13 (8): 2094–2106. PMC 6776030可免费查阅. PMID 31024153. doi:10.1038/s41396-019-0426-8.
  14. Del Prete S, Nocentini A, Supuran CT, Capasso C. . Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. December 2020, 35 (1): 1060–1068. PMC 7191908可免费查阅. PMID 32314608. doi:10.1080/14756366.2020.1755852.
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