连接埃德蒙顿龙

查爾斯·耐特所繪製的糙齒龍想像圖，其實是根據大鴨龍的化石所描繪的。

大鴨龍的分類有著很漫長、曲折的歷史。正模標本（編號AMNH 5730）是由J·L·沃特曼與R·S·希爾所發現的，發現於南達科塔州黑山（Black Hills）的地獄溪層，並於1882年由古生物學家愛德華·德林克·科普敘述、命名[4][10]。這個化石是一個完整頭顱骨及大部分骨骼，缺少骨盆與部分胸部，被河川的侵蝕、沖刷作用帶走。其口嘴部保存了角質鞘的組織[3]。在1856年，約瑟夫·萊迪（Joseph Leidy）建立奇異糙齒龍；雙芽龍則是在1876年由科普所命名，也是個根據牙齒而建立的物種。科普當時認為糙齒龍已不被使用，因此將奇異糙齒龍歸類於雙芽龍屬，並將這個發現於南達科塔州的部分骨骼歸類於奇異雙芽龍（Diclonius mirabilis）[1]。約瑟夫·萊迪當時已承認糙齒龍的化石來自於許多不相干的恐龍，並曾經重新研究，但沒有正式的發表過就逝世[11]。

在當時，科普將鴨嘴龍類敘述成生活在岸邊、水陸兩棲的動物，這個形象長久以來根植於大眾文化之中[12]。科普的理由是鴨嘴龍類的頜部關節虛弱，牠們若以陸地植物為食，頜部關節可能會脫落[1]。但是，科普當時取得的標本並不完全[13]，缺少頜部內側、支撐牙齒的骨頭，鴨嘴龍類的牙齒其實非常牢固[12][14]。自1899年起，美國自然歷史博物館買下大鴨龍的正模標本[7]。科普曾嘗試敘述整個頭骨與骨骼，但研究並沒有完成，就已死去[11]。

美國自然歷史博物館中的兩個科氏大鴨龍模型，分別是科普研究的正模標本（四足），以及布郎研究的近模標本（二足）

在1904年，蒙大拿州中部的地獄溪層發現另一個標本（編號AMNH 5886），由當地兩位牛仔發現，兩人爭論一些骨頭是否是化石，或是死去動物的骨頭，並曾用腳踢化石來測試，造成化石破碎。當地另一位牛仔以手槍與這兩位牛仔賣下這些化石，之後再轉售給巴納姆·布郎（Barnum Brown），巴納姆·布郎對這個化石遭到破壞感到遺憾，並在1906年完成這個化石的研究[10]。這個化石非常完整，包含幾乎整段脊柱。在1907年，美國自然歷史博物館將布朗與科普研究的標本，重建成兩個完整的骨架，以奇異糙齒龍的名稱展出。工作人員將科普研究的骨架架設成頭部低垂的進食姿勢，而將布朗研究的骨架架設成以二足方式站立。當時的美國自然歷史博物館館長亨利·費爾費爾德·奧斯本（Henry Fairfield Osborn）形容，進食的骨架是在沼澤進食，而站立的骨架是因暴龍接近而站起[3]。

在20世紀初期，鴨嘴龍類的分類發生非常大的改變，許多研究人員將原有物種改變分類，或是成為其他物種的異名，其中大部分物種的化石稀少、不完整。在1902年，海徹爾將鴨嘴龍類的柱齒龍、雙芽龍、鴨嘴龍、鳥踝龍、帆骨盆龍、強龍、破碎龍的一種，以及碎嘴龍、大師龍歸類於糙齒龍屬。海徹爾並認為馬什命名的C. annectens，與科普命名的奇異雙芽龍是相同物種，因個體差異或形變而被歸類於不同屬[15]。在1910年，加拿大與蒙大拿州發現的鴨嘴龍類化石，顯示鴨嘴龍類有高度生物多樣性[11]。在1915年，查爾斯·懷特尼·吉爾摩爾重新研究鴨嘴龍類，認為強龍的化石只發現於蘭斯組，糙齒龍的化石則發現於年代較早的朱迪斯河組，或是相同年代的地層[16]。

在1942年，理查·史旺·魯爾與尼爾達·萊特的北美洲鴨嘴龍科專題論文暫時解決這個問題，他們將C. annectens與數個化石建立為一個新屬，稱為鴨龍（Anatosaurus），屬名意為「鴨子蜥蜴」，模式種為A. annectens。而且，他們將長頭糙齒龍、奇異雙芽龍改歸類於鴨龍屬[17]。而在美國自然歷史博物館的骨骼，與A. annectens不是相同種，於是另建為科氏鴨龍，種名是為紀念科普首先的描述。科普研究的編號AMNH 5730標本成為科氏鴨龍的正模標本，而布朗研究的編號AMNH 5886標本則成為近模標本[7]。

魯爾與萊特的研究被延用了數十年。在70與80年代，Michael K. Brett-Surman在博士畢業研究中重新研究這些鴨嘴龍類化石。他提出鴨龍的模式種（A. annectens）是埃德蒙頓龍的一種，而科氏鴨龍則是獨立的屬[18][19][20]。雖然國際動物命名法委員會（International Commission on Zoological Nomenclature）並不承認畢業論文為正式研究，後來的科學家與論文多採用Brett-Surman的說法[21][22]。在1990年，Ralph Chapman與Brett-Surman正式發表學術研究，將科氏鴨龍建立為新屬，大鴨龍（Anatotitan），模式種是科氏大鴨龍（A. copei）。屬名是由拉丁文的鴨子（anas）與希臘文的泰坦（Titan）組合而成，意為「巨大的鴨子」[6][23]。

在1902年，海徹爾曾提出科氏大鴨龍的標本事實上是個Edmontosaurus annectens，而牠的頭顱骨在化石化期間經已被壓扁，才有現時的長扁外貌。在2004年，傑克·霍納（Jack Horner）、大衛·威顯穆沛（David B . Weishampel）、凱薩琳·福斯特（Catherine Forster）等人再度提出這個說法[9]。

在1889年，海徹爾在懷俄明州奈厄布拉勒縣的蘭斯組發現一個鴨嘴龍科下頜骨頭（編號YPM 616），這個部分下頜骨頭相當大、修長[8]。在1890年，奧塞內爾·查利斯·馬什將這個骨頭分類在長頭破碎龍[24]。但是於1942年， 古生物學家魯爾、萊特辨認出這個骨頭的側邊有明顯的稜脊，與科普敘述的標本類似。科普研究的化石是個齒骨，長約92公分；馬什研究的齒骨長度估計為110公分[8]。

在1991年，喬治·奧利舍夫斯基（George Olshevsky）將長頭破碎龍歸類於大鴨龍屬，成為長頭大鴨龍（A. longiceps）[25]。在1997年，唐諾·葛勒特（Donald F. Glut）的研究引用這個分類法[4]。而傑克·霍納與威顯穆沛認為長頭大鴨龍只是科氏大鴨龍的異名[26]。在2004年，兩人將長頭大鴨龍改歸類於埃德蒙頓龍的一種（E. annectens）[9]。