國立陽明交通大學

2001年3月發展生物科技時代之來臨，前國立陽明大學吳妍華校長及前國立交通大學張俊彥校長共同簽署合併意願書，同意合校後以「國立陽明交通大學」為校名。

2015年12月交大校務會議再度通過合校備忘錄。但因為事隔久遠，大部分在校生對於合校原委未詳細了解，並質疑校方決議過於倉促、流程黑箱，要求緩議。2016年初的校務會議否決了是項決議。

2018年9月26日陽明大學校務會議決議啟動合校，考慮與清華大學或是交大合併[9]，在清、交皆舉辦合校說明會，清、交亦均表態爭取與陽明合併。12月8日交大博愛校區前瞻跨領域生醫工程大樓（賢齊館）落成啟用，為未來預計與陽明合作之醫院之先聲[10]。12月26日，陽明、交大合併定案，啟動併校程序，校名暫定為「國立陽明交通大學」。[11]。

陽明大學校務會議最後決定合校對象依序為交通大學與清華大學，是因交大同意以國立陽明交通大學作為未來合校後的校名，而清大則未有定案。清華大學尊重陽明的決議，並祝福陽明及交大合校成功。清大另說，該校與陽明、交大、中大 同屬台聯大系統，未來仍將持續教學與研究的合作。[12]

2019年3月27日兩校正式通過合校意向書，準備提報教育部[13][14]，也因此交大停止新任校長遴選的準備工作[15]，將由代理校長擔任至合校為止[16]。4月16日交大與桃園市政府簽合作意向書，將在青埔桃園體育園區站旁打造國家級生醫研究中心，未來將與陽明合作開發[17]。6月2日陽明宣布109學年度起增設「醫師工程師組」，大一、大二先到交大電機學院修電機、資訊相關課程，大三以後回歸陽明醫學系，使用台聯大的校際選修系統進行，為兩校專業整合之前導[18][19]。8月30日確認校名為「國立陽明交通大學」，英文「National Yang-Ming Chiao Tung University」，簡稱YMCT，合校計畫書預計9月送兩校校務會議表決，再送教育部核定[20]，9月18日國立陽明大學及國立交通大學兩校校務會議皆通過合併計畫書，進行合校表決，確認於2020年8月1日成立新校[21][22]

2020年1月10日將英文校名的連字號 (hyphen)刪除，校名為「National Yang Ming Chiao Tung University」[7]，4月20日英文校名簡稱將改為NYCU[23][24]。5月6日舉行校徽說明會[25]，未產出最終校徽，現由兩校合校工作委員會下設識別系統設計小組專責處理[26]。6月24日教育部完成審議，兩校確認於2021年2月1日合併[27]。7月30日行政院同意陽明交大合併案，並啟動校長遴選[28]，2020年8月12日其合併計畫書獲教育部回函同意。[29]。根據《國立陽明大學與國立交通大學合併計畫書》，合校所需經費共計95億元，其中自籌65億元，其餘30億元向教育部申請補助。教育部最終核准4億元的基本設施補助，其餘新建館舍包含在台北陽明校區興建的智慧健康大樓共計26億元經費，將循行政院公共工程程序申請。[30]。11月5日共有6位候選人參選校長[31][32]，11月22日李友專、林一平、林奇宏通過第一階段遴選[33][34]。12月17日交大宣布將於2021年1月25日拆除校銜名稱[35][36]，使在校師生、校友蜂擁至交大校門口拍攝紀念照，變成熱門拍照景點，最盛時期甚至大排長龍[37][38][39]。

陽明交大甫成立的暫行識別標誌，可見合併後的英文校名「National Yang Ming Chiao Tung University」

2021年1月10日國立陽明交通大學校長遴選小組選定林奇宏為首任校長[40]。雖依照抽籤結果校址設定為光復校區，但林奇宏主張要以陽明、光復為雙校區[2]。1月17日陽明宣布將保留具有歷史意義的牌樓不更名，交大同樣保留博愛校區的牌樓[41][42]。1月21日交大宣布將於1月25日當天舉辦告別式[43]，同日兩校校長使用甫接通的各校區電話分機校內互打對談[44]。1月25日交大拆除校銜[45][46]，原定要進行的告別式因應疫情升溫停辦[47]。1月29日陽明拆除大門校銜並同時掛上新牌[48]。2月1日，國立陽明交通大學正式成立，陽明、光復兩校區分別在上、下午舉行揭牌典禮，並開通兩校區間校車[49]，校長表示將在百日內力拚讓兩校師生認同新學校，並擬定10年願景的3年計畫藍圖[50][51][52]，陽明交通大學是第一所由下而上自主合併成功的案例[53]，朝向「偉大大學」的方向邁進[54]。2月2日台南校區舉行揭牌儀式[55]。

2021年7月28日，教育部通過陽明交通大學設立產學創新研究學院，學院下設前瞻半導體研究所、智能系統研究所，預計110學年度開始招生。[56]

2022年1月11日，陽明交通大學與國立臺灣科技大學簽訂「學術交流與合作協議書」以及「合作備忘錄」，加強兩校的學術合作與交流，將以物聯網、人工智慧、網路、通訊為主題，發展「無線下載技術與天線量測技術研發及實驗場域」、「先進雷達技術」、「國防通訊與感測技術」、「智慧物聯網AIoT應用」、「人工智慧視覺技術」等技術領域，並促使兩校師生交流。[57]

2023年3月，於新竹光復校區成立「太空系統工程研究所」，結合校內前瞻火箭研究中心、工學院、電機學院、光電學院等單位師資，並與國家太空中心密切合作。以火箭系統工程、衛星與太空通訊系統為主軸培育跨領域太空人才[58][59]。

2023年5月18日，正式制定官方校徽與配色以及字體，校徽顏色為群青，中文標準字體取自孫中山書法集字（根據孫中山具醫師身分且其子孫科曾為國立交通大學校長）[60]。

2023年8月31日，教育部同意陽明交通大學增設中醫學系學士班，為臺灣首個國立大學設立中醫學系的案例[61]。

2023年9月，開設「學士後電子與光子學位學程」，引進非理工背景的大學畢業生投入半導體產業，與台積電、力積電等科技公司產學合作，是2年的學程[62]。

2023年9月，核准設立半導體工程學系，設置於電機學院，分為固態電子及奈米科學兩組，於2024年9月招收第一屆新生。[63]

預定於2024年，陽明校區人文與社會科學院、交大校區人文社會學院，整併為「人文藝術與社會學院」[64]。

光復校區位於新竹市東區，設有工學院、管理學院、理學院、電機學院、生物科技學院、人文社會學院、科技法律學院、資訊學院、國際半導體產業學院及產學創新研究學院，鄰近國立清華大學與新竹科學園區以及國家太空中心。

初期籌設過程，艱困二字都不足以形容，沈君山在《浮生三記》中有這一段描述：「...後來交通大學也在新竹復校，資深校友凌竹銘擔任復校籌備會的主任委員，卻沒地了，原來都給了梅校長。只好在清華後門外勉強的擠出九甲地，就這樣的擠了二十年，才再買到新校地。...」

在博愛校區竹銘館內，鐫刻前任校長盛慶琜所著之〈新闢光復校區記〉更提到，因校地難尋，中華民國陸軍威武營區也因屢次協調未成，已有遷往高雄市澄清湖畔的想法；最後在行政院院長蔣經國一句「科學也是國防」說服了態度強硬的軍方，使交大繼續留在新竹。[66][67]

陽明校區位於臺北市北投區，設有醫學院、生物醫學暨工程學院、護理學院、生命科學院、牙醫學院、藥物科學院及人文與社會科學院。

2019年4月16日，桃園市政府與國立交通大學簽訂《桃園市教育研發暨醫療園區合作意向書》[68]。青埔全球校區位置距離桃園捷運桃園體育園區站5分鐘，面積2.7公頃，主要作為推動「教育研發暨醫療園區」使用，未來將設立全球商管學院、醫療發展學院及一處醫學中心等級之醫院[69]，預計2022年完工啟用。

博愛校區位於新竹市東區，設有生物科技學院及跨領域生醫工程實驗動物中心。博愛校區是交通大學1958年在臺復校初始校地，1958年，政府徵收新竹市郊十八尖山下博愛街三公頃土地，以校友會捐款及美援經費補助興建第一棟校舍－竹銘館（前任校長淩鴻勛，字竹銘），當時作為教學研究、辦公與員生住宿之館舍，至1960年才興建第二棟校舍作為圖書館。1964年大學部恢復招生，先後設立四個學系。1973年，原有11.13公頃的校地已無法負荷漸增的學系和學生，為了未來發展需要，交大開始尋覓新校地，最終找到中華民國陸軍威武營區。1978年，奉准有償撥用威武營區；9月，光復校區行政大樓落成，校本部自博愛校區遷入，校務和辦學重心正式移轉。校方預計在此校區興建一研究型臨床醫院，冀望解決大新竹地區醫療資源嚴重不足的問題[70][71]。

六家校區位於新竹縣竹北市，設有客家文化學院。另在高鐵新竹站旁有臺灣知識旗艦園區計畫在進行。

陽明交大北門校區位於臺北郵局

北門校區原為交大台北校區，位於臺北郵局四樓，設有經營管理研究所[72]、交通運輸研究所。未來將配合臺北市政府西區門戶計畫，遷入「國家創意創新暨金融中心」大樓[73][74]。

陽明交大附醫本院（蘭陽院區）

蘭陽校區位於宜蘭縣宜蘭市，僅設國立陽明交通大學附設醫院，並分為本院（蘭陽院區）與新民院區。

奇美樓 (台南校區)

臺南校區位於臺南市歸仁區，鄰近高鐵臺南站及沙崙車站，設有光電學院、智慧科學暨綠能學院[75][76]。

士林校區位於臺北市士林區創新育成大樓。[77]

陽明交通大學共有10棟男生宿舍、7棟女生宿舍、9棟研究生宿舍，收費、房型等安排各異。[87][88]

分為交通館[89]與陽明館，交通館又可分為總館的浩然圖書資訊中心，以及北門校區、六家校區、台南校區各有圖書室，彼此間可流通書籍、代印[90]。兩校原本就是台聯大系統成員，館藏流通具有圖書代借代還服務，因此沒有什麼改變，只是從校際變成校內。

學校在光復校區、陽明校區及博愛校區皆設有運動場地，細節參閱#外部連結的國立陽明交通大學體育室

國立陽明交通大學全校性學生自治組織為國立陽明交通大學學生會[91]，由陽明分會（原國立陽明大學學生會）及交通分會（原國立交通大學學生聯合會）於110年2月1日組成。原兩校學生會於110年1月21日預先成立國立陽明交通大學學生會籌備委員會，以促成兩校學生會順利合併交接，並確保合校過程無損學生權益，在兩校合併前，就已完成單一全校性學生會的組織規章制定，期望兩校學生得以共同討論學生事務，目標讓合校後學生會可無縫接軌運作。[92]

依據國立陽明交通大學學生會組織規程及分會獨立的自治精神，陽明分會、交通分會各自獨立行使陽明校區、交通校區內學生自治事務，並各推派7名學生代表組成「學生代表大會」選舉會長、負責全校一致的學生權益問題、促進兩分會的溝通和合作、協調分會間的分工和爭議。[93]

陽明交通大學交大校區則有十項體育活動設有代表隊，包括籃球、排球、羽球、網球、桌球、棒球、足球、田徑、游泳、射箭；陽明校區共有七項體育活動設有代表隊，包括籃球、排球、羽球、網球、桌球、軟網、田徑，詳情可參見國立陽明交通大學體育室網頁[94]。

目前原交大校隊與原陽明大學暫時採取維持原狀，體育室擬持續爭取於合校後三年均仍以兩校區各自組隊參賽[95][96]。

梅竹賽是原交大與清大間，一系列十餘項的大型學藝、體育活動。梅竹賽於每年三月舉辦，競賽內容包括：棋藝、籃球、排球、足球、桌球、羽球、棒球、橋藝、網球等……，為兩所大學間的年度盛事。第一屆梅竹賽是在1969年，期間停賽過8次，截至2011年，交通大學以19比13暫時領先，當中有3次平手。此活動因在臺復校後校區相鄰而誕生，時至今日，梅竹賽已成為兩校共同的傳統，甚至是家喻戶曉的活動。1995年，梅竹賽與TVBS電視台合作製播梅竹賽專輯，將比賽實況透過網路播放。

2005年，原交大開始舉辦環校路跑，以光復校區為競賽場地，每人跑完兩圈（約4.4公里）視為跑完全程。2013年路線更改，第一圈為環校道路，第二圈為環校道路+西區（總計約5公里），完賽將可領取原創紀念衫一件[97]。

Open House 企業校園徵才[98]為學校為了幫助即將自陽明交通大學畢業的學生順利進入職場就業所舉辦的活動，表達出「打開學校大門，讓學生接觸社會的開始」。活動自1988年開始舉辦，當時第一屆學長姐提出了「一流人才，進一流企業」的標語。現在是校內每年吸引眾多的廠商及學生參與的活動之一，活動內容包括公司說明會、名人講座、企業徵才、抽獎等。

陽明十字軍於1978年創立，在成立前十年，以台灣子宮頸癌防治及衛教工作為主。而後轉型投入社區預防醫學服務，配合各地衛生所，針對40歲以上的民眾，挨家挨戶家訪，為民眾量血壓、驗尿糖，並轉介衛生所建檔追蹤診治，開啟社區預防醫學落實於基層的先驅。2012年起，陽明十字軍投入宜蘭地區，走訪宜蘭市38個里，拜訪過1萬餘名65歲以上長者，對健康情形追蹤，發現罹患1種以上慢性疾病比率達85%、2種以上亦接近60%，對宜蘭市在地流行病學，提供醫療機構及社福單位相當完整的田野資料。奠基於陽明十字軍宜蘭計畫的田野資料，在學術研究方面已於國際期刊陸續發表15篇著作，面向涵蓋睡眠、握力、衰弱、心律變異等，是相當具研究潛力之社區高齡世代研究。

藝術季自2000年由原交大開始舉辦，由藝文中心籌辦，每年皆有不同規劃且內容多元，多為講座、劇團演出、展覽。

原交通大學仿照MIT，所設立的OCW系統，還有師生互動的E3教學平臺[99]，甚至是線上教學與自1996年開辦至今的遠距教學的系統－開放式課程 [100]，讓學校的師生能有更多元的選擇方式來學習。兩校合併後的校區地理距離上相隔甚遠問題，也將使用遠距等方式解決[101]。

交通大學、陽明大學與清大、中央大學等研究型大學於2002年獲准共組，為臺灣第一個大學系統。目前推動中的合作項目包括：合聘教師、相互承認學分、舉辦聯合招生、校際轉系及跨校修讀輔系或修雙學位、合辦跨校之研究所及研究中心、共享圖書及貴重設備之資源。短期目標為整合四校之行政、教學及研究資源，長期目標期待能「整併四校為一校」。