SHC014病毒

2011年4月至2012年9月，中國科學院武漢病毒研究所石正麗實驗室的研究人員於中國雲南昆明採集中華菊頭蝠的腸道與糞便樣本，分析後發現其中除Rs672、Rf1與HKU3等數種已知的病毒株外，還有兩個新病毒株，即為SHC014病毒與Rs3367病毒[註 1]，兩種病毒的基因組大小均為29787nt，全基因組序列與嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒（SARS-CoV）的相似度均為95%，刺突蛋白中與宿主細胞血管紧张素转化酶2（ACE2）結合的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）胺基酸序列分別為85%與96%，皆高於當時已知的其他SARSr-CoV病毒株[2]，且兩者的RBD均不具有常見於其他蝙蝠SARSr-CoV、分別長5和12個胺基酸的兩段序列缺失，不過基因組中對SARS跨物種傳播相當重要的ORF8，SHC014病毒及Rs3367病毒與SARS病毒在此胺基酸序列的相似度分別只有32.2%與33%[3]。

SARS-CoV病毒的RBD中，與宿主受體ACE2直接接觸的胺基酸共有14個[註 2]，其中有5個為辨識宿主物種所需[註 3]。這14個位點中，WIV1病毒共有3個與SARS-CoV病毒不同，但仍能以ACE2為受體感染人類細胞，假性病毒實驗（pseudotyping）結果顯示這3個位點的差異並不影響病毒的感染；相較之下SHC014病毒在14個位點中有7個與SARS-CoV的不同，雖然假性病毒實驗結果顯示此差異足以影響病毒與ACE2的結合，使其難以感染細胞，但北卡羅來納大學教堂山分校的拉尔夫·S·巴里克與中國科學院武漢病毒研究所的石正麗合作，製作含有SHC014刺突蛋白、且已適應小鼠體內環境的SARS-CoV重組病毒（SHC014-MA15）後，卻發現此重組病毒可感染人類細胞與小鼠[註 4]，且用以治療SARS感染的單株抗體與疫苗均對此感染無效。研究人員進一步嘗試以SHC014感染人類細胞與小鼠，發現其雖有一定複製能力，但毒力比SARS-CoV低許多，這一系列重組病毒的實驗結果顯示自然界中的許多蝙蝠SARSr病毒刺突蛋白可能可與人類細胞的受體結合，因此具有跨物種感染人類的能力，雖然這些病毒可能仍需要其他基因的變異以適應人類宿主，惟其跨越物種障礙感染人類的機率，可能比原先認為的還高上許多[4]。

此研究結果發表後，有科學家質疑其風險過高，因為實驗中製造了可感染人類的重組病毒，若不慎溢出則後果不堪設想，而研究本身所提供的資訊有限，批評者並指出2014年10月（研究發表前數月）美國政府即公告禁止聯邦政府資助將SARS、MERS或流感病毒毒力與傳播能力提升或擴大宿主物種範圍的研究。論文作者與部分科學家則認為此研究結果揭示許多過去不被認為是重大風險的蝙蝠病毒已經跨越物種障礙，因此具有相當價值，病毒外洩的風險則過於誇大[5][6][7]。

2020年，2019冠状病毒病疫情爆發初期，有網路謠言指造成疫情的严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）可能是自實驗室洩漏，其中有指SARS-CoV-2為衍生自SHC014-MA15重組病毒者，但兩病毒的基因組序列差異甚大，沒有證據顯示兩者有關連[8]。

截至2021年1月 (2021-01)，SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹：