Folding@home

亨丁頓舞蹈症起因於第4對染色體異常，病發時會無法控制四肢，就像手舞足蹈一樣，並伴隨著智能減退，最後因吞嚥、呼吸困難等原因而死亡。

成骨不全症，又稱脆骨症，是一種先天性遺傳疾病，男女性患病的比例大約相同。這種疾病會造成第一型膠原纖維缺陷，使骨骼忍受外力衝擊的能力較正常人差，即使是輕微的碰撞，也會造成嚴重的骨折，因此這類的病患被稱為「玻璃娃娃」或「玻璃骨」。

彭德實驗室正利用Folding@home對一些病毒進行研究，對象包括流行性感冒病毒、人類免疫缺陷病毒（HIV）等，以尋找阻止病毒進入細胞的方法。歷史上全球曾多次出現高死亡率的週期性流感疫潮，其中1918年的西班牙流感導致全球近一億人死亡。當病毒感染細胞時，會發生「脂質雙層融合」（Lipid bilayer fusion/membrane fusion），其蛋白質會與細胞的蛋白質進行對接，過程之後或能進入細胞，或自我裹在細胞膜內。

2020年2月27日，Folding@home发布新的计算程序以研究2019-nCoV病毒。[9]分散式運算項目 Folding@home 宣佈加入新冠病毒 2019-nCoV 的研究以幫助研究人員開發出治療方法。Folding@home 指出：2019-nCoV 是 SARS 冠狀病毒（SARS-CoV）的「近親」，並且以類似的方式起作用。為了瞭解這些訊息，需要我們對 2019-nCoV 峰值蛋白的結構進行建模。我們需要構建可以實現此目標的計算模型，但它需要大量的運算能力。[10]

Folding @ Home正在模擬 COVID-19 蛋白質動態，以尋找新的治療機會。Folding @ Home專案總監Greg Bowman說明，蛋白質是執行許多與生命相關之各種功能的分子機器，它們能夠感應到味覺與嗅覺，也能執行肌肉收縮或食物分解等任務，還能發揮結構性作用，在許多情況下，會自發性地折疊成緊湊的功能結構。另一方面，病毒也具備蛋白質，可用來抑制人們的免疫系統並自我繁殖，為了對付COVID-19，必須了解這些病毒蛋白質的活動方式，以設計出能夠阻止它們的療法。但這樣的模擬需要強大運算資源，因此Bowman號召全球電腦用戶貢獻自己的閒置運算資源。不過，目前Folding @ Home尚未替COVID-19設置獨立類別，現在想貢獻COVID-19蛋白質折疊運算的使用者可選擇「Any Disease」，相關專案現都暫居於該類別中。[11][12]

前一陣子Nvidia在官方Twitter推文，呼籲PC遊戲玩家聯合起來對抗新型冠狀病毒(COVID-19)，方法是把自己閒置的GPU算力都捐出來，幫助科學家們做病毒研究──透過採用名為Folding@home的軟體，就能讓每個在家使用電腦的人把算力捐出來，每個人一點，就能以全球組合成網路的方式，構建起一個龐大的超級電腦。Folding@home在官網上提到，SARS-CoV病毒的「低解析度」結構已經有了，外加SARS-CoV和COVID-19的已知差別，Folding@home的這個項目就是要幫助構建起COVID-19棘突蛋白的結構，並識別抗體的靶點。而構建計算模型是需要海量算力的，這是Folding@home介入的原因。[13]

• GROMACS
  • Gromacs（Core 78）
    • 僅提供予所有單處理器平台使用。
  • DGromacs（Core 79）
    • Gromacs的雙倍精準版本，僅使用SSE2。
    • 僅提供予所有單處理器平台使用。
  • DGromacsB (Core 7b)
    • 名義上是DGromacs的更新版本，實際上是基於SMP／GPU版本的源碼的全新內核。兩者均在使用中。
    • Gromacs的雙倍精準版本，僅使用SSE2。
    • 僅提供予所有單處理器平台使用。
  • DGromacsC (Core 7c)
    • Gromacs的雙倍精準版本，僅使用SSE2。
    • 僅提供予單處理器的Windows及Linux平台使用。
  • GBGromacs（Core 7a）
  • Gromacs SREM（Core 80）
  • GroSimT（Core 81）
  • Gromacs 33（Core a0）
  • Gro-SMP（Core a1）
  • GroCVS（Core a2）
  • GroGPU2（Core 11及Core 13）
  • Gro-PS3（沒有編號，但也稱為SCEARD內核）
• AMBER
  • PMD (Core 82)
    • 未優化
    • 僅提供予單處理器的Windows及Linux平台使用。

• TINKER
  • Tinker core (Core 65)
    • 現已停止使用，並由速度更快的同類內核GBGromacs (Core 7a)所替代。
    • 未優化
    • 僅提供予所有單處理器平台使用。
• GROMACS
  • GroGPU (Core 10)
• CPMD
  • QMD (Core 96)

要快速運算蛋白質的摺疊效應，得需以高浮點運算能力的處理器進行，GPU具備強大浮點運算性能的優勢，Folding@home方面也著手開發供GPU使用的程式，把作業交給GPU運算。2006年10月2日，Folding@home公開發行供Windows系統使用的GPU測試版本，測試期間收到由450顆ATI X1900 GPU提供的31 TFLOPS運算性能，每顆顯核平均運算運力為一顆傳統CPU的70多倍。至2008年4月10日，第二代Windows GPU公開測試版推出，新版本支援ATI/AMD HD2xxx及HD3xxx系列，不用再透過DirectX介面與顯示核心溝通，並支援多GPU核心。供NVIDIA GPU使用的版本則利用CUDA技術，就可以使到GPU可以進行蛋白質摺疊運算。NVIDIA官方表示，只需全球0.1%支援CUDA的顯示卡進行運算，效能就可以達到7PFLOPS，遠超過超級電腦的計算水平[15]。現時已推出供啟用CUDA的NVIDIA GPU使用的公開測試版本。

索尼已加入Folding@home计划，從PS3的1.6版本韌體開始，支援該項目科学運算。由於PS3使用了Cell處理器，能提供強大的運算性能。當PS3闲置时，就會啟動運算程式，计算蛋白质的折叠效应，利用結果去研究各种疑难杂症。當CELL處理器運算時，NVIDIA的RSX顯核就會提供立體的蛋白质折叠實时图形展示。該图形展示效果不錯，支援1080p輸出，还有HDR效果。用户可利用手柄来控制觀賞角度。

PS3曾經為Folding@home提供最多的運算能力，隨著供NVIDIA GPU使用的軟件推出，NVIDIA GPU取代了PS3，成為了Folding@home的主力。截至2008年9月初，參與的PS3遊戲機為該計劃提供1,200多TFLOPS的運算能力，佔總數近35%。

隨著更多不同款式的多核處理器陸續推出，支援多核心的軟件也越來越多，Folding@home也加入支援對稱多處理機（SMP），希望藉此增強軟件的運算能力。透過利用MPI，軟件可同時使用多個內核進行運算。

支援SMP的Folding@home於2006年11月13日推出供x86-64 Linux及x86 Mac OS X執行的beta測試版本，現時也已推出供Win32使用的試版本，而供32位Linux執行的版本則仍在開發中。

一台PlayStation 3遊戲機的標稱功率為380W，由於Folding@Home是設計供CPU使用，因此會造成主機功耗達100%。但根據斯坦福方面有關PS3主機的常見問題，指出每台主機「在執行該程式時，其估計功率約為200W左右[16]」。截至2008年5月底，共有51,000多台PS3主機為該計劃提供1,400多TFlops的運算能力，每台PS3平均提供近30,000MFlops，以史丹福的每台主機200W輸出（使用90nm製程的處理器）估計，每瓦輸出提供150多MFlops[17]。隨著PS3的Cell處理器改用更微細的65nm及45nm製程，處理器的功耗會進一步下降，其每瓦輸出提供的運算的能力也會提高。

取决于PC本身CPU最大能耗以及计算程序设置。