將軍澳嶼

將軍澳嶼無機場，須乘船舶至望安島轉搭飛機（望安航空站）往高雄。

將軍澳嶼西側的將軍南漁港

將軍嶼共有兩座港口，分別位於島嶼西側與西北側。依據漁業署資料，分別為將軍南漁港（將軍漁港）與將軍北漁港（宮漁港），依漁業法分類兩者皆為第二類漁港。

將軍南漁港，港深3公尺，面積25,000平方公尺，因位於島嶼背風側且與望安島潭門港遙遙相對，故為將軍嶼聚落（將軍村）所在地，成為居民主要進出交通門戶。設籍將軍南港船筏高達百餘艘，漁業從業人口眾多，早期將軍澳更被人稱為「船長的故鄉」。然本地市場較小且漁業設施不足，漁民需赴馬公或七美交易與補給。

將軍北漁港因天后宮位於港邊，亦有人稱「宮港」，或因位於村後，而稱「後港」。將軍北漁港離聚落較遠，故主要交通與漁業皆以南港為主。設籍將軍北港之漁船不足十艘。然而將軍北港座東朝西，使得該港為颱風期間之良好避風港。

鄉公所於週一到週五期間安排「將軍之星」快艇定時往返望安、將軍二島，航程約4至5分鐘。

欲從將軍往返馬公本島者，須搭小船至望安再轉乘噸數較大的交通船（相對的，從馬公本島欲至將軍，則必須到達望安後才能轉船至將軍）。目前定時往返望安至馬公本島的公營交通船，為澎湖縣公共車船管理處經營的350噸級南海之星客、貨兩用交通船。望安至馬公的航程約50分鐘。

往返望安島有漁船兼營的渡輪，如欲搭乘可就近洽詢海巡署安檢所弟兄，其航程約5至15分鐘。

往返望安、將軍至馬公本島的大型民營交通船，為198噸的「光正六號」客、貨兩用交通船， 「光正六號」每天定時於早上約7點（冬令時間約7點30分）從望安出發至將軍，再從將軍開往馬公本島；下午約2點30分，則從馬公本島南下開往將軍，再從將軍開往望安，航程約50至60分鐘（視氣候、船隻狀況而定）。

夏令時間（冬天之前），每天都有民營小型遊艇加入運輸往返望安至馬公（馬公至望安）的旅客行列，航程約40分鐘。冬令時間，由於受到澎湖強烈的東北季風影響，一般民營的這些快艇都會停止行駛。

由門仔海峽北望望安（左側）與將軍（右側）兩島。左圖（2006年）可見進行中的望將大橋工程，右圖（2021年）中海面建物均已拆除。

將軍澳嶼環島濱海公路至2023年前僅餘船帆嶼北段尚未鋪設，然2023年已鋪設完成，有完整的環狀公路。島上主要交通工具為機車，雖多數居民住在島上西南側港口邊，但仍需要機動交通工具。

橫跨將軍、望安兩島的望將大橋於1995年12月16日依據行政院台一四交44418號函核定列入「澎湖生活圈道路系統建設計畫」內執行，台灣省公路局於1997年委託規劃設計，由朝國營造廠得標，並於2002年11月10日開工興建。望將大橋連接澎湖望安鄉本島與將軍嶼，主橋長440公尺，加上兩端引道總長1,753公尺，為懸臂式設計，號稱完工後是全台最長的懸臂式大橋。[7]但是礙於技術難度、建材物料上漲等因素，工程進行至38%進度時，包商便棄標停工，再次招標作業後，仍陸續流標7次。

2008年8月15日，交通部做出停工結案的決定，並於9月拆除[8][9][10]，原先建造的引道與橋墩迄2013年已拆除完畢。