門川站

屬第三代站房，由與門川町商工會的社區中心「APIO」結合而成的複合式站房，並由商工會管理日常站務及車票事宜，屬於簡易委託車站。用作車站用途的部份設於地下的中央部份的後端。左側為售票窗口；右側擺放了宣傳單架及兩張候車長櫈，中央為開放式驗票口，服務時間內會有委託職員負責查驗車票的工作。至於前端則為門川町觀光協會服務站「Gallery Theatre」（），右側為門川町商工會的正門，旁邊放置了自動售賣機。

設有側式月台及島式月台各1個，共提供2面3線的配置，長度約為120米，有效長度為6輛，但3號月台向延岡方向的末端被圍欄所封，所以只有4輛。其中貼近大樓的側式月台（1號月台）為主月台，所有級的上行列車均在此停靠；下行列車則視乎情況，所有停靠的特急列車都會使用1號月台，通過的特急如果需要交匯，則會改使用2號月台，而普通列車如不須交匯也是使用1號月台，需要的話則視乎情況使用2或3號月台。其中，觀光列車「九州七星號」如果日間造訪，則會停靠3號月台。

1號月台向延岡方向的末端仍保留過往供貨物車卡停靠的頭端式側線1條。

月台之間以行人天橋連結，但沒有升降機、無障礙斜道或車站內跨線平交道前往島式月台。所有月台皆為全露天配置，亦只有在島式月台上設置了一座以水泥磚及鐵皮搭成的候車亭，每側各附有兩張四獨立候車座椅。

以木及磚所建成的單層站房一座，是為着首代站房因第二次世界大戰期間被燒毀而重建，是一座面積十分大的站房[3]。站房中間為大堂及驗票口，左側為站務室，右側為候車大堂。